Questions marquées «biostatistics»

La science des statistiques appliquée à l'analyse de données biologiques ou médicales.

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Corrélations entre variables continues et catégorielles (nominales)
J'aimerais trouver la corrélation entre une variable continue (variable dépendante) et une variable catégorique (nominale: genre, variable indépendante). Les données continues ne sont pas normalement distribuées. Auparavant, je l'avais calculé en utilisant Spearman . Cependant, on m'a dit que ce n'est pas correct.ρρ\rho Lors de mes recherches sur Internet, j’ai …
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Comment fonctionne une distribution de Poisson lors de la modélisation de données continues et entraîne-t-elle une perte d'informations?
Une collègue analyse certaines données biologiques pour sa thèse avec une mauvaise hétéroscédasticité (figure ci-dessous). Elle est en train de l'analyser avec un modèle mixte mais a toujours des problèmes avec les résidus. La transformation logarithmique des variables de réponse nettoie les choses et sur la base des commentaires sur …
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Quelles sont les études de cas dans la recherche sur les politiques de santé publique où des études ou des modèles peu fiables / confus / invalides ont été mal utilisés?
Je rédige une revue de la littérature sur un problème de santé publique actuel où les données sont confondues: Quelles sont les études de cas historiques courantes utilisées dans l'enseignement de la santé publique / épidémiologie où des relations ou des inférences invalides ou confondues ont été intentionnellement ou erronément …
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Calcul de la probabilité de chevauchement de la liste de gènes entre une séquence d'ARN et un ensemble de données de puce ChIP
J'espère que quelqu'un sur ces forums pourra m'aider avec ce problème de base dans les études d'expression génique. J'ai fait un séquençage profond d'un tissu expérimental et d'un tissu témoin. J'ai ensuite obtenu des valeurs d'enrichissement par repli des gènes dans l'échantillon expérimental par rapport au contrôle. Le génome de …
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Le test
Je viens de lire dans un magazine scientifique (populaire) plutôt bien respecté (le PM allemand, 02/2013, p.36) sur une expérience intéressante (sans source, malheureusement). Cela a attiré mon attention parce que je doutais intuitivement de la signification du résultat, mais les informations fournies étaient suffisantes pour reproduire le test statistique. …
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Hypothèse nulle d'équivalence
Supposons que sont un simple échantillon aléatoire d'une distribution normale .X1,X2,...,XnX1,X2,...,XnX_1, X_2, \, ... \, , X_n(μ,σ2)(μ,σ2)(\mu,\sigma^2) Je suis intéressé à faire le test d'hypothèse suivant: pour une constante donnée .H0:|μ|≤cH1:|μ|>c,H0:|μ|≤cH1:|μ|>c, H_0: | \mu| \le c \\ H_1: |\mu| > c, c>0c>0c > 0 Je pensais effectuer deux tests unilatéraux …
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Estimation des ratios de risque ajustés dans les données binaires à l'aide de la régression de Poisson
Je m'intéresse à l'estimation d'un rapport de risque ajusté, analogue à la façon dont on estime un rapport de cotes ajusté en utilisant la régression logistique. Certaines publications (par exemple, ceci ) indiquent que l'utilisation de la régression de Poisson avec les erreurs standard de Huber-White est une façon basée …
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Comment effectuer une SVD pour imputer des valeurs manquantes, un exemple concret
J'ai lu les excellents commentaires sur la façon de traiter les valeurs manquantes avant d'appliquer SVD, mais j'aimerais savoir comment cela fonctionne avec un exemple simple: Movie1 Movie2 Movie3 User1 5 4 User2 2 5 5 User3 3 4 User4 1 5 User5 5 1 5 Étant donné la matrice …
8 r  missing-data  data-imputation  svd  sampling  matlab  mcmc  importance-sampling  predictive-models  prediction  algorithms  graphical-model  graph-theory  r  regression  regression-coefficients  r-squared  r  regression  modeling  confounding  residuals  fitting  glmm  zero-inflation  overdispersion  optimization  curve-fitting  regression  time-series  order-statistics  bayesian  prior  uninformative-prior  probability  discrete-data  kolmogorov-smirnov  r  data-visualization  histogram  dimensionality-reduction  classification  clustering  accuracy  semi-supervised  labeling  state-space-models  t-test  biostatistics  paired-comparisons  paired-data  bioinformatics  regression  logistic  multiple-regression  mixed-model  random-effects-model  neural-networks  error-propagation  numerical-integration  time-series  missing-data  data-imputation  probability  self-study  combinatorics  survival  cox-model  statistical-significance  wilcoxon-mann-whitney  hypothesis-testing  distributions  normal-distribution  variance  t-distribution  probability  simulation  random-walk  diffusion  hypothesis-testing  z-test  hypothesis-testing  data-transformation  lognormal  r  regression  agreement-statistics  classification  svm  mixed-model  non-independent  observational-study  goodness-of-fit  residuals  confirmatory-factor  neural-networks  deep-learning 
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Que fait exactement une marche aléatoire?
Pour être honnête, j'ai lu de nombreux sites Web et réponses concernant cette question, et aucun ne l'a expliquée en termes simples et compréhensibles. Ce que je veux faire, c'est comprendre ce que fait une marche aléatoire et comment elle peut être utilisée pour l'analyse d'enrichissement des ensembles de gènes. …
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