Statistiques et Big Data glmm

3

Comment puis-je tester si un effet aléatoire est significatif?

J'essaie de comprendre quand utiliser un effet aléatoire et quand c'est inutile. On m'a dit qu'une règle de base est si vous avez 4 groupes / individus ou plus que je fais (15 orignaux individuels). Certains de ces orignaux ont été expérimentés à deux ou trois reprises pour un total …

34 mixed-model lme4-nlme random-effects-model glmm

3

Différence entre les modèles linéaires généralisés et les modèles mixtes linéaires généralisés

Je me demande quelles sont les différences entre les GLM mixtes et non mélangées. Par exemple, dans SPSS, le menu déroulant permet aux utilisateurs d’inscrire: analyze-> generalized linear models-> generalized linear models Et analyze-> mixed models-> generalized linear Traitent-ils différemment les valeurs manquantes? Ma variable dépendante est binaire et j'ai …

34 mixed-model generalized-linear-model glmm gee

2

Diagnostics pour les modèles linéaires généralisés (mixtes) (en particulier les résidus)

J'ai actuellement du mal à trouver le bon modèle pour les données de comptage difficiles (variable dépendante). J'ai essayé différents modèles (des modèles à effets mixtes sont nécessaires pour mon type de données) tels que lmeret lme4(avec une transformation logarithmique) ainsi que des modèles à effets mixtes linéaires généralisés avec …

25 generalized-linear-model residuals negative-binomial count-data glmm

2

Pourquoi est-ce que j'obtiens une variance nulle d'un effet aléatoire dans mon modèle mixte, malgré certaines variations dans les données?

Nous avons exécuté une régression logistique à effets mixtes en utilisant la syntaxe suivante; # fit model fm0 <- glmer(GoalEncoding ~ 1 + Group + (1|Subject) + (1|Item), exp0, family = binomial(link="logit")) # model output summary(fm0) Le sujet et l'objet sont les effets aléatoires. Nous obtenons un résultat étrange qui …

22 r mixed-model stata glmm lme4-nlme

2

Comment appliquer le GLMM binomial (glmer) à des pourcentages plutôt qu'à des nombres oui-non?

J'ai une expérience à mesures répétées où la variable dépendante est un pourcentage et j'ai plusieurs facteurs comme variables indépendantes. Je voudrais utiliser à glmerpartir du package R lme4pour le traiter comme un problème de régression logistique (en spécifiant family=binomial) car il semble s'adapter directement à cette configuration. Mes données …

21 r logistic mixed-model glmm lme4-nlme

4

Comment évaluer l'ajustement d'un GLMM binomial équipé de lme4 (> 1.0)?

J'ai un GLMM avec une distribution binomiale et une fonction de lien logit et j'ai le sentiment qu'un aspect important des données n'est pas bien représenté dans le modèle. Pour tester cela, je voudrais savoir si les données sont bien décrites par une fonction linéaire sur l'échelle logit. Par conséquent, …

19 binomial residuals glmm lme4-nlme

1

Signification d'un avertissement de convergence dans Glmer

J'utilise la glmerfonction du lme4package dans R, et j'utilise l' bobyqaoptimiseur (c'est-à-dire la valeur par défaut dans mon cas). Je reçois un avertissement et je suis curieux de savoir ce que cela signifie. Warning message: In optwrap(optimizer, devfun, start, rho$lower, control = control, : convergence code 3 from bobyqa: bobyqa …

16 r optimization lme4-nlme convergence glmm

1

Comment adapter un modèle mixte avec une variable de réponse entre 0 et 1?

J'essaie d'utiliser lme4::glmer()pour adapter un modèle mixte généralisé binomial (GLMM) avec une variable dépendante qui n'est pas binaire, mais une variable continue entre zéro et un. On peut considérer cette variable comme une probabilité; en fait , il est probable que rapporté par des sujets humains (dans une expérience que …

15 r logistic mixed-model glmm lme4-nlme

1

Comment les effets aléatoires avec une seule observation affecteront-ils un modèle mixte linéaire généralisé?

J'ai un ensemble de données dans lequel la variable que j'aimerais utiliser comme effet aléatoire n'a qu'une seule observation pour certains niveaux. Sur la base des réponses aux questions précédentes, j'ai compris que, en principe, cela peut convenir. Puis-je adapter un modèle mixte avec des sujets qui n'ont qu'une seule …

14 r mixed-model generalized-linear-model glmm lme4-nlme

1

Calcul de l'ICC pour la régression logistique à effets aléatoires

J'utilise un modèle de régression logistique sous la forme: lmer(response~1+(1|site), family=binomial, REML = FALSE) Normalement, je calculerais l'ICC à partir des variances d'interception et résiduelles, mais le résumé du modèle n'inclut pas la variance résiduelle. Comment puis-je calculer cela?

13 logistic lme4-nlme glmm

1

Surdispersion et alternatives de modélisation dans les modèles à effet aléatoire de Poisson avec décalages

J'ai rencontré un certain nombre de questions pratiques lors de la modélisation des données de comptage issues de la recherche expérimentale à l'aide d'une expérience intra-sujet. Je décris brièvement l'expérience, les données et ce que j'ai fait jusqu'à présent, suivi de mes questions. Quatre films différents ont été montrés en …

12 generalized-linear-model negative-binomial glmm poisson-regression overdispersion

2

Comment tester la surdispersion dans Poisson GLMM avec lmer () dans R?

J'ai le modèle suivant: > model1<-lmer(aph.remain~sMFS1+sAG1+sSHDI1+sbare+season+crop +(1|landscape),family=poisson) ... et voici la sortie récapitulative. > summary(model1) Generalized linear mixed model fit by the Laplace approximation Formula: aph.remain ~ sMFS1 + sAG1 + sSHDI1 + sbare + season + crop + (1 | landscape) AIC BIC logLik deviance 4057 4088 -2019 4039 …

12 r poisson-distribution lme4-nlme glmm overdispersion

1

Modèle marginal versus modèle à effets aléatoires - comment choisir entre eux? Un conseil pour un profane

En recherchant des informations sur le modèle marginal et le modèle à effets aléatoires , et comment choisir entre eux, j'ai trouvé quelques informations mais c'était une explication plus ou moins mathématique abstraite (comme par exemple ici: https: //stats.stackexchange .com / a / 68753/38080 ). Quelque part, j'ai constaté qu'il …

11 mixed-model random-effects-model glmm gee marginal-model

2

Modèles mixtes linéaires généralisés: diagnostics

J'ai une régression logistique d'interception aléatoire (due à des mesures répétées) et je voudrais faire quelques diagnostics, en particulier concernant les valeurs aberrantes et les observations influentes. J'ai regardé les résidus pour voir s'il y a des observations qui ressortent. Mais je voudrais aussi regarder quelque chose comme la distance …

11 mixed-model outliers glmm cooks-distance

1

Ajustement d'un GLMM binomial (glmer) à une variable de réponse qui est une proportion ou une fraction

J'espère que quelqu'un peut aider avec ce que je pense être une question relativement simple, et je pense que je connais la réponse, mais sans confirmation, c'est devenu quelque chose dont je ne peux tout simplement pas être certain. J'ai des données de comptage comme variable de réponse et je …

11 r binomial proportion glmm lme4-nlme

Questions marquées «glmm»