Statistiques et Big Data survival

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Quelle est la différence entre la sortie «coef» et «(exp) coef» de coxph dans R?

J'ai essayé de discerner ce que signifient exactement les sorties "coef" et "(exp) coef" de coxph. Il semble que les "(exp) coef" soient des comparaisons de la première variable du modèle selon le groupe assigné dans la commande. Comment la fonction coxph arrive-t-elle aux valeurs de "coef" et "(exp) coef"? …

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Comment les modèles d'apprentissage automatique (GBM, NN, etc.) peuvent-ils être utilisés pour l'analyse de survie?

Je sais que les modèles statistiques traditionnels comme la régression des risques proportionnels de Cox et certains modèles de Kaplan-Meier peuvent être utilisés pour prédire jours jusqu'à la prochaine occurrence d'une panne par exemple d'événements , etc. -à- dire l' analyse de survie Des questions Comment la version de régression …

13 machine-learning classification survival cox-model kaplan-meier

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Explication de Layman de la censure dans l'analyse de survie

J'ai lu ce qu'est la censure et comment elle doit être prise en compte dans l'analyse de survie, mais j'aimerais en entendre une définition moins mathématique et une définition plus intuitive (les images seraient super!). Quelqu'un peut-il me fournir une explication de 1) la censure et 2) comment cela affecte …

13 survival cox-model censoring

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L'ajustement du modèle de Cox avec des strates et l'interaction strate-covariable diffère-t-il de l'ajustement de deux modèles de Cox?

Dans Regression Modeling Strategies de Harrell (deuxième édition), il y a une section (S. 20.1.7) traitant des modèles de Cox, y compris une interaction entre une covariable dont nous voulons également estimer l'effet principal sur la survie (âge dans l'exemple ci-dessous) et un covariable dont nous ne voulons pas estimer …

13 survival cox-model stratification

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Interprétation et validation d'un modèle de régression des risques proportionnels de Cox à l'aide de R en anglais simple

Quelqu'un peut-il m'expliquer mon modèle Cox en anglais simple? J'ai ajusté le modèle de régression de Cox suivant à toutes mes données en utilisant la cphfonction. Mes données sont enregistrées dans un objet appelé Data. Les variables w, xet ysont continues; zest un facteur de deux niveaux. Le temps est …

13 r cross-validation survival cox-model

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Comment rapporter les ratios de risque d'un modèle de risques proportionnels de Cox en anglais?

D'après ce que je comprends, un rapport de risque d'un modèle de risques proportionnels de Cox compare l'effet sur le taux de risque d'un facteur donné à un groupe de référence. Comment rapporteriez-vous cela à un public qui ne connaît pas les statistiques? Essayons d'exprimer un exemple. Disons que nous …

13 survival cox-model

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Package GBM vs Caret utilisant GBM

J'ai ajusté le modèle à l'aide caret, mais j'ai ensuite réexécuté le modèle à l'aide du gbmpackage. Je crois comprendre que le caretpackage utilise gbmet que la sortie doit être la même. Cependant, un simple test rapide utilisant data(iris)montre une différence dans le modèle d'environ 5% en utilisant RMSE et …

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Un modèle de régression dont la variable de réponse est le jour de l'année où un événement annuel se produit (généralement)

Dans ce cas particulier, je fais référence au jour où un lac gèle. Cette date "glacée" n'a lieu qu'une fois par an, mais parfois elle ne se produit pas du tout (si l'hiver est chaud). Ainsi, sur une année, le lac peut geler le jour 20 (20 janvier) et une …

13 regression time-series survival data-transformation recurrent-events

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Comment générer des courbes de survie prédites à partir de modèles de fragilité (en utilisant R coxph)?

Je veux calculer la fonction de survie prédite pour un modèle de risques proportionnels de Cox avec des termes de fragilité [en utilisant le package de survie]. Il semble que lorsque des termes de fragilité figurent dans le modèle, la fonction de survie prévue ne peut pas être calculée. ## …

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Comment estimer la fonction de risque de base dans le modèle de Cox avec R

J'ai besoin d'estimer la fonction de risque de base dans un modèle de Cox dépendant du tempsλ0(t)λ0(t)\lambda_0(t) λ(t)=λ0(t)exp(Z(t)′β)λ(t)=λ0(t)exp⁡(Z(t)′β)\lambda(t) = \lambda_0(t) \exp(Z(t)'\beta) Pendant que je suivais le cours de survie, je me souviens que la dérivée directe de la fonction de risque cumulatif ( ) ne serait pas un bon estimateur …

13 r survival cox-model

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Modélisation lorsque la variable dépendante a un «seuil»

Toutes mes excuses à l'avance si l'une des terminologies que j'utilise est incorrecte. J'accueillerais toute correction. Si ce que je décris comme une «coupure» porte un nom différent, faites-le moi savoir et je pourrai mettre à jour la question. La situation qui m'intéresse est la suivante: vous avez des variables …

12 regression modeling survival censoring

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Quelles sont les différences entre l'analyse de survie et la régression de Poisson?

Je travaille sur un problème de prédiction d'attrition classique en utilisant le nombre de visites d'un utilisateur donné sur un site et je pensais que la régression de Poisson était le bon outil pour modéliser l'engagement futur de cet utilisateur. À ce moment-là, je suis tombé sur un livre sur …

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Comparez deux courbes de survie pour les données appariées

Je veux comparer deux méthodes différentes pour détecter un changement d'état dans une analyse de survie. Un groupe de sujets est suivi pendant une période plus longue (plusieurs années) et deux méthodes d'examen ont été utilisées pour déterminer si un changement de statut s'est produit; une méthode a été utilisée …

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Différences entre PROC Mixed et lme / lmer en R - degrés de liberté

Remarque: cette question est une rediffusion, car ma question précédente a dû être supprimée pour des raisons juridiques. En comparant PROC MIXED de SAS avec la fonction lmedu nlmepackage dans R, je suis tombé sur des différences assez confuses. Plus précisément, les degrés de liberté dans les différents tests diffèrent …

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Comment comparer la survie médiane entre les groupes?

J'examine la survie médiane en utilisant Kaplan-Meier dans différents états pour un type de cancer. Il existe de grandes différences entre les États. Comment puis-je comparer la survie médiane entre tous les États et déterminer lesquels sont significativement différents de la survie médiane moyenne à travers le pays?

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