Questions marquées «negative-binomial»

Une distribution discrète et univariée modélisant le nombre de Bernoullje(p) succès des essais jusqu'à ce qu'un nombre spécifié d'échecs se produise.

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Comment projeter un nouveau vecteur sur l'espace PCA?
Après avoir effectué l'analyse des composants principaux (PCA), je souhaite projeter un nouveau vecteur sur l'espace PCA (c'est-à-dire trouver ses coordonnées dans le système de coordonnées PCA). J'ai calculé PCA en langage R en utilisant prcomp. Maintenant, je devrais pouvoir multiplier mon vecteur par la matrice de rotation PCA. Les …
21 r  pca  r  variance  heteroscedasticity  misspecification  distributions  time-series  data-visualization  modeling  histogram  kolmogorov-smirnov  negative-binomial  likelihood-ratio  econometrics  panel-data  categorical-data  scales  survey  distributions  pdf  histogram  correlation  algorithms  r  gpu  parallel-computing  approximation  mean  median  references  sample-size  normality-assumption  central-limit-theorem  rule-of-thumb  confidence-interval  estimation  mixed-model  psychometrics  random-effects-model  hypothesis-testing  sample-size  dataset  large-data  regression  standard-deviation  variance  approximation  hypothesis-testing  variance  central-limit-theorem  kernel-trick  kernel-smoothing  error  sampling  hypothesis-testing  normality-assumption  philosophical  confidence-interval  modeling  model-selection  experiment-design  hypothesis-testing  statistical-significance  power  asymptotics  information-retrieval  anova  multiple-comparisons  ancova  classification  clustering  factor-analysis  psychometrics  r  sampling  expectation-maximization  markov-process  r  data-visualization  correlation  regression  statistical-significance  degrees-of-freedom  experiment-design  r  regression  curve-fitting  change-point  loess  machine-learning  classification  self-study  monte-carlo  markov-process  references  mathematical-statistics  data-visualization  python  cart  boosting  regression  classification  robust  cart  survey  binomial  psychometrics  likert  psychology  asymptotics  multinomial 
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Quelles sont les valeurs correctes pour la précision et le rappel dans les cas de bord?
La précision est définie comme: p = true positives / (true positives + false positives) Est - il exact que, true positiveset false positivesapproche 0, la précision approche 1? Même question pour rappel: r = true positives / (true positives + false negatives) J'implémente actuellement un test statistique où j'ai …
20 precision-recall  data-visualization  logarithm  references  r  networks  data-visualization  standard-deviation  probability  binomial  negative-binomial  r  categorical-data  aggregation  plyr  survival  python  regression  r  t-test  bayesian  logistic  data-transformation  confidence-interval  t-test  interpretation  distributions  data-visualization  pca  genetics  r  finance  maximum  probability  standard-deviation  probability  r  information-theory  references  computational-statistics  computing  references  engineering-statistics  t-test  hypothesis-testing  independence  definition  r  censoring  negative-binomial  poisson-distribution  variance  mixed-model  correlation  intraclass-correlation  aggregation  interpretation  effect-size  hypothesis-testing  goodness-of-fit  normality-assumption  small-sample  distributions  regression  normality-assumption  t-test  anova  confidence-interval  z-statistic  finance  hypothesis-testing  mean  model-selection  information-geometry  bayesian  frequentist  terminology  type-i-and-ii-errors  cross-validation  smoothing  splines  data-transformation  normality-assumption  variance-stabilizing  r  spss  stata  python  correlation  logistic  logit  link-function  regression  predictor  pca  factor-analysis  r  bayesian  maximum-likelihood  mcmc  conditional-probability  statistical-significance  chi-squared  proportion  estimation  error  shrinkage  application  steins-phenomenon 
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GLM binomial négatif ou transformation logarithmique pour les données de comptage: augmentation du taux d'erreur de type I
Certains d'entre vous ont peut-être lu ce bel article: O'Hara RB, Kotze DJ (2010) Ne pas enregistrer les données de comptage par transformation. Méthodes en écologie et évolution 1: 118-122. Klick . Dans mon domaine de recherche (écotoxicologie), nous avons affaire à des expériences mal reproduites et les GLM ne …
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Distribution qui décrit la différence entre les variables distribuées binomiales négatives?
Une distribution de Skellam décrit la différence entre deux variables qui ont des distributions de Poisson. Existe-t-il une distribution similaire qui décrit la différence entre les variables qui suivent des distributions binomiales négatives? Mes données sont produites par un processus de Poisson, mais incluent une bonne quantité de bruit, conduisant …
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Un problème d'estimation impossible?
Question La variance d'une distribution binomiale négative (NB) est toujours supérieure à sa moyenne. Lorsque la moyenne d'un échantillon est supérieure à sa variance, essayer d'ajuster les paramètres d'un NB avec une probabilité maximale ou avec une estimation de moment échouera (il n'y a pas de solution avec des paramètres …
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Comment ajuster une distribution discrète pour compter des données?
J'ai l'histogramme suivant des données de comptage. Et je voudrais y adapter une distribution discrète. Je ne sais pas comment je dois procéder. Dois-je d'abord superposer une distribution discrète, disons distribution binomiale négative, sur l'histogramme afin d'obtenir les paramètres de la distribution discrète, puis d'exécuter un test de Kolmogorov-Smirnov pour …
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Cadrer la distribution binomiale négative pour le séquençage de l'ADN
La distribution binomiale négative est devenue un modèle populaire pour les données de comptage (en particulier le nombre attendu de lectures de séquençage dans une région donnée du génome d'une expérience donnée) en bioinformatique. Les explications varient: Certains l'expliquent comme quelque chose qui fonctionne comme la distribution de Poisson mais …
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Poisson est exponentiel comme Gamma-Poisson est quoi?
Une distribution de Poisson peut mesurer des événements par unité de temps et le paramètre est . La distribution exponentielle mesure le temps jusqu'au prochain événement, avec le paramètre . On peut convertir une distribution dans l'autre, selon qu'il est plus facile de modéliser des événements ou des heures.λλ\lambda1λ1λ\frac{1}{\lambda} Maintenant, …
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Quand quelqu'un dit que la déviance résiduelle / df devrait ~ 1 pour un modèle de Poisson, quelle est approximative approximative?
J'ai souvent vu les conseils pour vérifier si un ajustement du modèle de Poisson est trop dispersé, ce qui implique de diviser la déviance résiduelle par les degrés de liberté. Le rapport résultant doit être "environ 1". La question est de savoir de quelle plage parlons-nous pour "approximative" - ​​quel …
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dispersion in summary.glm ()
J'ai dirigé un glm.nb par glm1<-glm.nb(x~factor(group)) avec groupe étant une catégorie et x une variable métrique. Lorsque j'essaie d'obtenir le résumé des résultats, j'obtiens des résultats légèrement différents, selon que j'utilise summary()ou summary.glm. summary(glm1)Donne moi ... Coefficients: Estimate Std. Error z value Pr(>|z|) (Intercept) 0.1044 0.1519 0.687 0.4921 factor(gruppe)2 0.1580 …
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