Statistiques et Big Data cox-model

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Comment rapporter les ratios de risque d'un modèle de risques proportionnels de Cox en anglais?

D'après ce que je comprends, un rapport de risque d'un modèle de risques proportionnels de Cox compare l'effet sur le taux de risque d'un facteur donné à un groupe de référence. Comment rapporteriez-vous cela à un public qui ne connaît pas les statistiques? Essayons d'exprimer un exemple. Disons que nous …

13 survival cox-model

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Package GBM vs Caret utilisant GBM

J'ai ajusté le modèle à l'aide caret, mais j'ai ensuite réexécuté le modèle à l'aide du gbmpackage. Je crois comprendre que le caretpackage utilise gbmet que la sortie doit être la même. Cependant, un simple test rapide utilisant data(iris)montre une différence dans le modèle d'environ 5% en utilisant RMSE et …

13 r caret gbm matrix linear-algebra logistic modeling logit ordered-logit r confidence-interval survival population weibull classification separation hypothesis-testing correlation statistical-significance p-value python r data-visualization r regression multiple-regression chi-squared multivariate-analysis distributions random-variable experiment-design distributions poisson-regression residuals excel time-series garch var survival modeling cox-model interaction r pca normality-assumption

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Comment générer des courbes de survie prédites à partir de modèles de fragilité (en utilisant R coxph)?

Je veux calculer la fonction de survie prédite pour un modèle de risques proportionnels de Cox avec des termes de fragilité [en utilisant le package de survie]. Il semble que lorsque des termes de fragilité figurent dans le modèle, la fonction de survie prévue ne peut pas être calculée. ## …

13 r survival cox-model frailty

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Comment estimer la fonction de risque de base dans le modèle de Cox avec R

J'ai besoin d'estimer la fonction de risque de base dans un modèle de Cox dépendant du tempsλ0(t)λ0(t)\lambda_0(t) λ(t)=λ0(t)exp(Z(t)′β)λ(t)=λ0(t)exp⁡(Z(t)′β)\lambda(t) = \lambda_0(t) \exp(Z(t)'\beta) Pendant que je suivais le cours de survie, je me souviens que la dérivée directe de la fonction de risque cumulatif ( ) ne serait pas un bon estimateur …

13 r survival cox-model

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Comment créer des données de survie de jouet (temps avant l'événement) avec une censure à droite

Je souhaite créer une donnée de survie du jouet (temps avant l'événement) qui est censurée à droite et suit une certaine distribution avec des dangers proportionnels et un danger de base constant. J'ai créé les données comme suit, mais je ne suis pas en mesure d'obtenir des ratios de risque …

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Test exact de Fisher et distribution hypergéométrique

Je voulais mieux comprendre le test exact du pêcheur, j'ai donc imaginé l'exemple de jouet suivant, où f et m correspond à l'homme et à la femme, et n et y correspond à la "consommation de soda" comme ceci: > soda_gender f m n 0 5 y 5 0 Évidemment, …

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Résidus de Schoenfeld

Dans un modèle de risques proportionnels de Cox avec de nombreuses variables, si les résidus de Schoenfeld ne sont pas plats pour l'une des variables, cela invalide-t-il le modèle entier ou peut-on simplement ignorer la variable peu performante? C'est-à-dire, interpréter les coefficients pour les autres variables, mais ne pas interpréter …

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Comment calculer les taux de risque prévus à partir d'un modèle Cox PH?

J'ai le modèle Cox PH suivant: (Heure, événement) ~ X + Y + Z Je voudrais obtenir les risques prévus taux (je parle des taux de risque NON ratios danger) , étant donné les valeurs spécifiques de X, Y, Z. Je sais que le package muhaz R peut calculer les …

11 r survival hazard cox-model

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Comment analyser au mieux les données sur la durée du séjour dans un ECR en milieu hospitalier?

Je souhaite savoir s'il existe ou non un consensus sur la meilleure façon d'analyser les données sur la durée de séjour à l'hôpital à partir d'un ECR. Il s'agit généralement d'une distribution très asymétrique, où la plupart des patients sortent en quelques jours à une semaine, mais les autres patients …

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Pondération du score de propension dans l'analyse Cox PH et la sélection des covariables

Concernant la pondération du score de propension (IPTW) lors de la modélisation du risque proportionnel de Cox des données de survie dans le temps: J'ai des données de registre prospectives où nous souhaitons étudier l'effet du traitement d'un médicament que, dans la plupart des cas, les patients prenaient déjà au …

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Comparaison de la CPH, du modèle de temps de défaillance accéléré ou des réseaux de neurones pour l'analyse de survie

Je suis nouveau dans l'analyse de survie et j'ai récemment appris qu'il existe différentes façons de le faire en fonction d'un certain objectif. Je suis intéressé par la mise en œuvre réelle et la pertinence de ces méthodes. On m'a présenté les traditionnels risques proportionnels de Cox , les modèles …

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Comment le coxphe () de R gère-t-il les mesures répétées?

Le contexte J'essaie de comprendre comment coxph () de R accepte et gère les entrées répétées pour les sujets (ou le patient / client si vous préférez). Certains appellent ce format long, d'autres l'appellent «mesures répétées». Voir par exemple l'ensemble de données qui inclut la colonne ID dans la section …

10 r repeated-measures survival cox-model frailty

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Y a-t-il une différence fonctionnelle entre un rapport de cotes et un rapport de risque?

Dans la régression logistique, un rapport de cotes de 2 signifie que l'événement est 2 fois plus probable compte tenu d'une augmentation d'une unité du prédicteur. Dans la régression de Cox, un rapport de risque de 2 signifie que l'événement se produira deux fois plus souvent à chaque instant, compte …

10 logistic cox-model odds-ratio hazard

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R régression linéaire variable catégorielle valeur «cachée»

Ceci est juste un exemple que j'ai rencontré plusieurs fois, donc je n'ai pas d'échantillons de données. Exécution d'un modèle de régression linéaire dans R: a.lm = lm(Y ~ x1 + x2) x1est une variable continue. x2est catégorique et a trois valeurs, par exemple "Low", "Medium" et "High". Cependant, la …

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Les courbes de Kaplan-Meier semblent dire autre chose que la régression de Cox

Dans R, je fais l'analyse des données de survie des patients cancéreux. J'ai lu des informations très utiles sur l'analyse de survie dans CrossValidated et dans d'autres endroits et je pense avoir compris comment interpréter les résultats de la régression de Cox. Cependant, un résultat me dérange toujours ... Je …

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