Statistiques et Big Data meta-analysis

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Package Metafor: diagnostics de biais et de sensibilité

Je mène une méta-analyse à plusieurs niveaux qui comprend des articles aux résultats multiples. Par conséquent, j'utilise la rma.mv()fonction. Exemple de code: test.main = rma.mv(yi,vi,random = ~1|ID, data = data) J'ai deux questions: J'ai lu dans une requête précédente que lors de l'utilisation rma.mv(), ce ranktest()n'est pas un test fiable …

9 meta-analysis sensitivity-analysis publication-bias funnel-plot

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Schémas de pondération alternatifs pour la méta-analyse des effets aléatoires: écarts-types manquants

Je travaille sur une méta-analyse des effets aléatoires couvrant un certain nombre d'études qui ne rendent pas compte des écarts-types; toutes les études indiquent la taille de l'échantillon. Je ne pense pas qu'il soit possible d'approximer ou d'imputer les données SD manquantes. Comment pondérer une méta-analyse qui utilise des différences …

9 stata missing-data meta-analysis meta-regression

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Comment gérer au mieux les sous-scores dans une méta-analyse?

Je mène une méta-analyse des tailles d'effet d dans R en utilisant le package metafor. d représente les différences de scores de mémoire entre les patients et les sains. Cependant, certaines études ne rapportent que des sous-scores de la mesure d'intérêt d (par exemple, plusieurs scores de mémoire différents ou …

9 r meta-analysis effect-size meta-regression

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Question sur la pondération à variance inverse

Supposons que nous voulons faire une inférence sur une réalisation non observée d'une variable aléatoire , qui est normalement distribuée avec la moyenne et la variance . Supposons qu'il existe une autre variable aléatoire (dont nous appellerons également réalisation non observée ) qui est normalement distribuée avec la moyenne et …

9 meta-analysis

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Quelle est la différence entre une approche fréquentiste avec méta-analyse et une approche bayésienne?

Supposons que j'effectue une analyse portant sur une mesure de santé particulière. Je m'intéresse à la différence dans cette mesure entre les patients et les témoins et si oui ou non la différence est différente de 0. Il y a eu des études dans le passé sur ma même question …

9 bayesian meta-analysis case-control-study

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Bootstrap paramétrique, semi-paramétrique et non paramétrique pour les modèles mixtes

Les greffes suivantes sont extraites de cet article . Je suis novice dans le bootstrap et j'essaie d'implémenter le bootstrap paramétrique, semi-paramétrique et non paramétrique pour le modèle mixte linéaire avec le R bootpackage. Code R Voici mon Rcode: library(SASmixed) library(lme4) library(boot) fm1Cult <- lmer(drywt ~ Inoc + Cult + …

9 r mixed-model bootstrap central-limit-theorem stable-distribution time-series hypothesis-testing markov-process r correlation categorical-data association-measure meta-analysis r anova confidence-interval lm r bayesian multilevel-analysis logit regression logistic least-squares eda regression notation distributions random-variable expected-value distributions markov-process hidden-markov-model r variance group-differences microarray r descriptive-statistics machine-learning references r regression r categorical-data random-forest data-transformation data-visualization interactive-visualization binomial beta-distribution time-series forecasting logistic arima beta-regression r time-series seasonality large-data unevenly-spaced-time-series correlation statistical-significance normalization population group-differences demography

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Comment calculer l'erreur standard des rapports de cotes?

J'ai deux ensembles de données provenant d'études d'association à l'échelle du génome. Les seules informations disponibles sont le rapport de cotes et la valeur de p pour le premier ensemble de données. Pour le deuxième ensemble de données, j'ai le rapport de cotes, la valeur de p et les fréquences …

9 meta-analysis genetics

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Comment calculer les intervalles de confiance pour les ratios impairs regroupés dans la méta-analyse?

J'ai deux ensembles de données provenant d'études d'association à l'échelle du génome. Les seules informations disponibles sont les rapports impairs et leurs intervalles de confiance (95%) pour chaque SNP génotypé. Je veux générer un graphique forestier comparant ces deux rapports de cotes, mais je ne trouve pas le moyen de …

9 confidence-interval meta-analysis genetics odds-ratio

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Méta-analyse sur des études avec des cellules de fréquence 0

Je connais les techniques de méta-analyse et de méta-régression (en utilisant le package R metaforde Viechtbauer), mais je suis récemment tombé sur un problème que je ne peux pas facilement résoudre. Disons que nous avons une maladie qui peut aller de la mère à l'enfant à naître, et elle a …

9 meta-analysis odds-ratio relative-risk

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Pourquoi la méthode de Stouffer fonctionne-t-elle?

Cela semble être une question assez simple, mais quand j'y pense vraiment, la méthode de Stouffer n'a pas de sens pour moi. C'est pourquoi: Supposons une hypothèse bilatérale. Vous calculez d'abord partir des valeurs de . Prenons donc un exemple assez simple. Prenons deux valeurs de de . Cela signifie …

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Dans une méta-analyse, comment gérer des études non significatives ne contenant pas de données brutes?

Disons que je mène une méta-analyse, en examinant la performance du groupe A et du groupe B par rapport à une certaine construction. Maintenant, certaines des études que je vais rencontrer rapporteront qu'aucune différence statistique n'a pu être trouvée entre les deux groupes mais aucune statistique de test exacte et …

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Causes des distributions bimodales lors du démarrage d'un modèle de méta-analyse

J'aide un collègue à amorcer un modèle d'effets mixtes de méta-analyse en utilisant le framework de package metafor R créé par @Wolfgang. Fait intéressant et inquiétant, pour l'un des coefficients du modèle, j'obtiens une distribution bimodale lors du bootstrap (voir le panneau en bas à droite de la figure ci-dessous). …

8 r mixed-model bootstrap meta-analysis bimodal

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Méta-régression multivariée multiniveau

Contexte: je voudrais effectuer une méta-régression en utilisant des études qui ont (1) plusieurs résultats / constructions (= multivariées) et (2) plusieurs tailles d'effet pour chacun de ces résultats en raison de différentes mesures. Voici un schéma qui, je l'espère, l'explique le mieux: Étude 1, résultat A, taille d'effet 1 …

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Convertir le rapport de risques en rapport de cotes

En méta-analyse: comment convertir les ratios de risque dans certaines études en odds ratio? Il y a des études de cas témoins et de cohorte à inclure et certaines d'entre elles font état de ratios de risque. Les données brutes ne sont pas rapportées de manière à calculer le rapport …

8 meta-analysis

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Valeurs R étrangement grandes dans la méta régression (métafor)

J'utilise le package metafor dans R. J'ai ajusté un modèle d'effets aléatoires avec un prédicteur continu comme suit SIZE=rma(yi=Ds,sei=SE,data=VPPOOLed,mods=~SIZE) Ce qui donne la sortie: R^2 (amount of heterogeneity accounted for): 63.62% Test of Moderators (coefficient(s) 2): QM(df = 1) = 9.3255, p-val = 0.0023 Model Results: se zval pval ci.lb …

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