Science computationnelle

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Des recommandations pour une bibliothèque de matrices C ++ rapide et utilisable?

Quelqu'un a-t-il des recommandations sur une bibliothèque matricielle C ++ rapide et utilisable? Ce que je veux dire par utilisable est le suivant: Les objets matriciels ont une interface intuitive (ex.: Je peux utiliser des lignes et des colonnes lors de l'indexation) Je peux faire n'importe quoi avec la classe …

158 linear-algebra software implicit-methods

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Est-il utile d'écrire des tests unitaires pour les codes de recherche scientifique?

Je suis fermement convaincu de l'intérêt d'utiliser des tests qui vérifient un programme complet (par exemple, des tests de convergence), y compris un ensemble automatisé de tests de régression . Après avoir lu quelques livres de programmation, j'ai eu le sentiment harcelant que je "devais" écrire des tests unitaires (c'est-à-dire, …

89 programming-paradigms testing

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Quels types de problèmes se prêtent bien à l’informatique GPU?

J'ai donc une tête décente pour les problèmes avec lesquels je travaille qui sont les meilleurs en série et qui peuvent être gérés en parallèle. Mais pour le moment, je n'ai pas une très bonne idée de ce qui est le mieux géré par un calcul basé sur le processeur, …

84 gpu

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Existe-t-il un solveur de programmation non linéaire de haute qualité pour Python?

J'ai plusieurs problèmes d'optimisation globale non convexe difficiles à résoudre. Actuellement, j'utilise la boîte à outils Optimization de MATLAB (en particulier, fmincon()avec algorithm = 'sqp'), ce qui est assez efficace . Cependant, la majeure partie de mon code est en Python et j'aimerais également en faire l'optimisation. Existe-t-il un solutionneur …

77 python optimization nonlinear-programming linear-algebra linear-solver sparse-matrix ode automatic-differentiation efficiency matrix symbolic-computation pde multiphysics operator-splitting fluid-dynamics pde multigrid pde hyperbolic-pde quadrature precision numerical-analysis fluid-dynamics interpolation c ode testing data-sets pde fluid-dynamics hyperbolic-pde pde finite-element fluid-dynamics stability incompressible pde hyperbolic-pde fluid-dynamics pde precision floating-point convex-optimization conditioning pde hyperbolic-pde stability implicit-methods explicit-methods fluid-dynamics accuracy pde hyperbolic-pde petsc linear-algebra

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À quel point les compilateurs Fortran sont-ils vraiment meilleurs?

Cette question est une extension de deux discussions qui ont récemment été abordées dans les réponses à " C ++ vs Fortran pour HPC ". Et c'est un peu plus un défi qu'une question ... L'un des arguments les plus souvent entendus en faveur de Fortran est que les compilateurs …

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Quelles sont les bonnes stratégies pour améliorer les performances en série de mon code?

Je travaille dans le domaine de la science informatique et, par conséquent, je passe une bonne partie de mon temps à essayer d’accroître le débit scientifique de nombreux codes, ainsi qu’à en comprendre l’efficacité. Supposons que j’ai évalué le compromis performance / lisibilité / réutilisabilité / maintenabilité du logiciel sur …

66 performance

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C ++ vs Fortran pour HPC

Dans mon programme de doctorat en sciences informatiques, nous travaillons presque exclusivement en C ++ et en Fortran. Il semble que certains professeurs préfèrent l'un à l'autre. Je me demande lequel est 'meilleur' ou si l'un est meilleur que l'autre dans certaines circonstances.

56 hpc fortran c++ languages

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Comment prendre la FFT de données irrégulièrement espacées?

L'algorithme Fast Fourier Transform calcule une décomposition de Fourier en supposant que ses points d'entrée sont équidistants dans le domaine temporel, . Et s'ils ne le sont pas? Y a-t-il un autre algorithme que je pourrais utiliser, ou une manière de modifier la FFT, pour prendre en compte ce qui …

55 fourier-analysis

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Quelle est la maturité du projet de langage informatique «Julia»?

J'envisage d'apprendre un nouveau langage à utiliser pour les projets de modélisation numérique / de simulation, en remplacement (partiel) du C ++ et du Python que j'utilise actuellement. Je suis tombé sur Julia , ce qui semble être parfait. S'il fait tout ce qu'il dit, je pourrais l'utiliser pour remplacer …

55 parallel-computing languages julia

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Est-il courant de ne pas utiliser de bibliothèques pour des algorithmes numériques standard, et pourquoi?

De nombreux algorithmes numériques (intégration, différenciation, interpolation, fonctions spéciales, etc.) sont disponibles dans des bibliothèques de calcul scientifiques telles que GSL . Mais je vois souvent du code avec des implémentations "roulées à la main" de ces fonctions. Pour les petits programmes qui ne sont pas nécessairement destinés à une …

54 libraries c

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Quelles sont les compétences fondamentales que chaque scientifique en informatique devrait posséder? [fermé]

Chaque scientifique doit en savoir un peu plus sur les statistiques: quelle est la corrélation, quel est l’intervalle de confiance, et ainsi de suite. De même, chaque scientifique devrait en savoir un peu plus sur l’informatique: la question est de savoir quoi. À quoi peut-on raisonnablement s'attendre de ce que …

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Quelles directives dois-je suivre lors du choix d'un solveur de système linéaire creuse?

Les systèmes linéaires clairsemés apparaissent de plus en plus fréquemment dans les applications. On a beaucoup de routines à choisir pour résoudre ces systèmes. Au niveau le plus élevé, il existe un fossé entre les méthodes directes (par exemple, l’élimination gaussienne ou la décomposition de Cholesky, avec des algorithmes de …

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Quelles sont les différences conceptuelles entre la méthode des éléments finis et la méthode des volumes finis?

Il existe une différence évidente entre la méthode des différences finies et celle des volumes finis (passage de la définition ponctuelle des équations aux moyennes intégrales sur les cellules). Mais je trouve que FEM et FVM sont très similaires; ils utilisent tous les deux la forme intégrale et la moyenne …

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Quels sont les critères de choix entre les différences finies et les éléments finis

Je suis habitué à considérer les différences finies comme un cas particulier d'éléments finis, sur une grille très contrainte. Quelles sont donc les conditions pour choisir entre la méthode des différences finies (FDM) et la méthode des éléments finis (FEM) en tant que méthode numérique? Du côté de la méthode …

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Quels sont les bons moyens de documenter un logiciel scientifique?

Souvent, quand j'ai hérité ou rencontré du code scientifique écrit par d'autres personnes (ou parfois même par mon propre travail), j'ai remarqué que la documentation était soit rare, soit inexistante. Si j'ai de la chance, je vois des commentaires informatifs. Si j'ai beaucoup de chance, il y a même des …

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