lme4 et nlme sont des packages R utilisés pour ajuster des modèles d'effets mixtes linéaires, linéaires généralisés et non linéaires. Pour les questions générales sur les modèles mixtes, utilisez la balise [mixed-model].
Comment obtenir des poids de régression normalisés (à effet fixe) à partir d'une régression à plusieurs niveaux? Et, en tant que "module complémentaire": Quelle est la façon la plus simple d'obtenir ces poids standardisés à partir d'un mer-objet (à partir de la lmerfonction du lme4package dans R)?
Le mgcvpackage pour Ra deux fonctions pour ajuster les interactions des produits tensoriels: te()et ti(). Je comprends la division de base du travail entre les deux (ajustement d'une interaction non linéaire vs décomposition de cette interaction en effets principaux et interaction). Ce que je ne comprends pas, c'est pourquoi te(x1, …
Je travaille sur un ensemble de données afin d'évaluer l'impact du séchage sur les activités microbiennes des sédiments. L'objectif est de déterminer si l'impact du séchage varie selon les types de sédiments et / ou la profondeur dans les sédiments. La conception expérimentale est la suivante: Le premier facteur Sédiment …
J'espère que quelqu'un peut aider avec ce que je pense être une question relativement simple, et je pense que je connais la réponse, mais sans confirmation, c'est devenu quelque chose dont je ne peux tout simplement pas être certain. J'ai des données de comptage comme variable de réponse et je …
On m'a récemment dit qu'il n'était pas possible d'incorporer des covariables variant dans le temps dans des modèles mixtes longitudinaux sans introduire un décalage dans le temps pour ces covariables. Pouvez-vous confirmer / nier cela? Avez-vous des références sur cette situation? Je propose une situation simple à clarifier. Supposons que …
J'essaie de reproduire plusieurs tests d'interaction entre les deux lmet lmersur des mesures répétées (2x2x2). La raison pour laquelle je veux comparer les deux méthodes est que le GLM de SPSS pour les mesures répétées donne exactement les mêmes résultats que l' lmapproche présentée ici, donc à la fin je …
J'essaie de calculer les prédictions d'effet aléatoire à partir d'un modèle mixte linéaire à la main, et en utilisant la notation fournie par Wood dans les modèles additifs généralisés: une introduction avec R (pg 294 / pg 307 du pdf), je suis confus sur ce que chaque paramètre représente. Voici …
En contrepartie de ce poste , j'ai travaillé sur la simulation de données avec des variables continues, se prêtant à des interceptions et des pentes corrélées. Bien qu'il existe d'excellents articles sur ce sujet sur le site et en dehors du site , j'ai eu du mal à trouver un …
Dans la lmerfonction au sein lme4de Ril y a un appel à la construction d' une matrice de modèle d'effets aléatoires, , comme expliqué ici , pages 7 - 9.ZZZ Le calcul de implique les produits de KhatriRao et / ou Kronecker de deux matrices, et . J i X …
J'effectue des tests post-hoc sur un modèle linéaire à effets mixtes dans R( lme4package). J'utilise multcomppackage ( glht()fonction) pour effectuer les tests post-hoc. Mon plan expérimental est des mesures répétées, avec un effet de bloc aléatoire. Les modèles sont spécifiés comme: mymod <- lmer(variable ~ treatment * time + (1|block), …
Étant donné trois variables, yet xqui sont positives continues et zqui sont catégoriques, j'ai deux modèles candidats donnés par: fit.me <- lmer( y ~ 1 + x + ( 1 + x | factor(z) ) ) et fit.fe <- lm( y ~ 1 + x ) J'espère comparer ces modèles …
La formule que l'on doit spécifier pour la formation d'un modèle à plusieurs niveaux (à l'aide lmerde la lme4 Rbibliothèque) m'obtient toujours. J'ai lu d'innombrables manuels et tutoriels, mais je ne l'ai jamais bien compris. Voici donc un exemple de ce tutoriel que j'aimerais voir formulé dans une équation. Nous …
J'analyse les résultats d'une expérience de temps de réaction chez R. J'ai effectué une ANOVA à mesures répétées (1 facteur intra-sujet avec 2 niveaux et 1 facteur inter-sujet avec 2 niveaux). J'ai exécuté un modèle mixte linéaire similaire et je voulais résumer les résultats de lmer sous la forme d'une …
Pour un exemple simple, supposons qu'il existe deux modèles de régression linéaire Modèle 1 a trois prédicteurs, x1a, x2betx2c Le modèle 2 a trois prédicteurs du modèle 1 et deux prédicteurs supplémentaires x2aetx2b Il existe une équation de régression de la population où la variance de la population expliquée est …
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