Questions marquées «lme4-nlme»

lme4 et nlme sont des packages R utilisés pour ajuster des modèles d'effets mixtes linéaires, linéaires généralisés et non linéaires. Pour les questions générales sur les modèles mixtes, utilisez la balise [mixed-model].

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Aide-mémoire de lmer de R
Il y a beaucoup de discussions sur ce forum sur la bonne façon de spécifier divers modèles hiérarchiques en utilisant lmer. J'ai pensé que ce serait génial d'avoir toutes les informations au même endroit. Quelques questions pour commencer: Comment spécifier plusieurs niveaux, où un groupe est imbriqué dans l'autre: est-ce …

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Effets aléatoires croisés et imbriqués: en quoi diffèrent-ils et comment sont-ils spécifiés correctement dans lme4?
Voici comment j'ai compris les effets aléatoires imbriqués et croisés: Les effets aléatoires imbriqués se produisent lorsqu'un facteur de niveau inférieur apparaît uniquement dans un niveau particulier d'un facteur de niveau supérieur. Par exemple, les élèves dans les classes à un moment donné. En lme4pensant que nous représentons les effets …





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Quel est le lien entre un «modèle à effets aléatoires» en économétrie et des modèles mixtes extérieurs à l'économétrie?
J'avais l'habitude de penser que le "modèle à effets aléatoires" en économétrie correspond à un "modèle mixte avec interception aléatoire" en dehors de l'économétrie, mais je ne suis pas sûr à l'heure actuelle. Le fait-il? L'économétrie utilise des termes tels que "effets fixes" et "effets aléatoires", ce qui diffère quelque …


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Interprétation du prédicteur et / ou de la réponse transformé par log
Je me demande si cela fait une différence d'interprétation si seules les variables dépendantes, indépendantes et dépendantes, ou uniquement les variables indépendantes sont transformées par un journal. Considérons le cas de log(DV) = Intercept + B1*IV + Error Je peux interpréter l'IV comme l'augmentation en pourcentage, mais comment cela change-t-il …
46 regression  data-transformation  interpretation  regression-coefficients  logarithm  r  dataset  stata  hypothesis-testing  contingency-tables  hypothesis-testing  statistical-significance  standard-deviation  unbiased-estimator  t-distribution  r  functional-data-analysis  maximum-likelihood  bootstrap  regression  change-point  regression  sas  hypothesis-testing  bayesian  randomness  predictive-models  nonparametric  terminology  parametric  correlation  effect-size  loess  mean  pdf  quantile-function  bioinformatics  regression  terminology  r-squared  pdf  maximum  multivariate-analysis  references  data-visualization  r  pca  r  mixed-model  lme4-nlme  distributions  probability  bayesian  prior  anova  chi-squared  binomial  generalized-linear-model  anova  repeated-measures  t-test  post-hoc  clustering  variance  probability  hypothesis-testing  references  binomial  profile-likelihood  self-study  excel  data-transformation  skewness  distributions  statistical-significance  econometrics  spatial  r  regression  anova  spss  linear-model 


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Pourquoi glmer n'atteint-il pas le maximum de vraisemblance (comme le prouve l'application d'une optimisation générique supplémentaire)?
Dériver numériquement les MLE de GLMM est difficile et, dans la pratique, je sais que nous ne devrions pas utiliser l'optimisation de la force brute (par exemple, en utilisant optimune méthode simple). Mais pour mon propre but éducatif, je veux l'essayer pour m'assurer de bien comprendre le modèle (voir le …

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Intervalle de prédiction pour le modèle à effets mixtes lmer () dans R
Je veux obtenir un intervalle de prédiction autour d'une prédiction à partir d'un modèle lmer (). J'ai trouvé des discussions à ce sujet: http://rstudio-pubs-static.s3.amazonaws.com/24365_2803ab8299934e888a60e7b16113f619.html http://glmm.wikidot.com/faq mais ils semblent ne pas tenir compte de l'incertitude des effets aléatoires. Voici un exemple spécifique. Je cours des poissons d'or. J'ai des données sur …

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Dans quelle mesure les intervalles de confiance des objets lmer sont-ils fiables dans le paquet d'effets?
Effectspackage fournit un moyen très rapide et pratique pour tracer les résultats de modèle à effets mixtes linéaires obtenus par lme4package . leeffect fonction calcule très rapidement les intervalles de confiance (IC), mais dans quelle mesure ces intervalles de confiance sont-ils fiables? Par exemple: library(lme4) library(effects) library(ggplot) data(Pastes) fm1 <- …

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Qu'est-ce que la symétrie composée en anglais?
J'ai récemment réalisé qu'un modèle mixte avec un seul sujet comme facteur aléatoire et les autres facteurs comme facteurs fixes équivaut à une ANOVA lors de la définition de la structure corrélationnelle du modèle mixte sur une symétrie composée. Par conséquent, j'aimerais savoir ce que signifie la symétrie composée dans …

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Modèle à effets mixtes avec imbrication
J'ai des données recueillies à partir d'une expérience organisée comme suit: Deux sites de 30 arbres chacun. 15 sont traités, 15 sont contrôlés sur chaque site. De chaque arbre, nous échantillonnons trois morceaux de la tige et trois morceaux des racines, soit 6 échantillons de niveau 1 par arbre, représentés …

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