lme4 et nlme sont des packages R utilisés pour ajuster des modèles d'effets mixtes linéaires, linéaires généralisés et non linéaires. Pour les questions générales sur les modèles mixtes, utilisez la balise [mixed-model].
J'essaie d'intégrer un modèle mixte multivarié (c'est-à-dire à réponses multiples) R. Mis à part les packages ASReml-ret SabreR(qui nécessitent un logiciel externe), il semble que cela ne soit possible qu'en MCMCglmm. Dans l' article qui accompagne le MCMCglmmpaquet (p. 6), Jarrod Hadfield décrit le processus d'ajustement d'un tel modèle comme …
Je viens de (re) lire pourquoi nous n'avons généralement pas à nous soucier des comparaisons multiples . En particulier, la section «Résultats multiples et autres défis» mentionne l'utilisation d'un modèle hiérarchique pour les situations où il existe plusieurs mesures connexes de la même personne / unité à différents moments / …
Je souhaite modéliser deux variables temporelles différentes, dont certaines sont fortement colinéaires dans mes données (âge + cohorte = période). Ce faisant, j'ai rencontré des problèmes avec lmeret et les interactions de poly(), mais ce n'est probablement pas limité à lmer, j'ai obtenu les mêmes résultats avec l' nlmeIIRC. De …
Je termine une analyse sur un grand ensemble de données. Je voudrais prendre le modèle linéaire utilisé dans la première partie du travail et le réajuster en utilisant un modèle mixte linéaire (LME). Le LME serait très similaire à l'exception que l'une des variables utilisées dans le modèle serait utilisée …
C'est plus une question conceptuelle, mais comme je l'utilise, Rje ferai référence aux packages de R. Si l'objectif est d'adapter un modèle linéaire à des fins de prédiction, puis de faire des prédictions là où les effets aléatoires pourraient ne pas être disponibles, y a-t-il un avantage à utiliser un …
J'analyse certaines données comportementales en utilisant lme4in R, principalement en suivant les excellents tutoriels de Bodo Winter , mais je ne comprends pas si je gère correctement les interactions. Pire encore, personne d'autre impliqué dans cette recherche n'utilise des modèles mixtes, donc je suis un peu à la dérive quand …
Quelle est la structure de variance-covariance par défaut pour les effets aléatoires dans glmerou lmerdans le lme4package? Comment spécifier une autre structure variance-covariance pour les effets aléatoires dans le code? Je n'ai trouvé aucune information à ce sujet dans la lme4documentation.
Je me sens dépassé après avoir tenté de creuser dans la littérature sur la façon d'exécuter mon analyse de modèle mixte, en suivant l'utilisation d'AIC pour sélectionner le ou les meilleurs modèles. Je ne pense pas que mes données soient si compliquées, mais je recherche la confirmation que ce que …
Comment puis-je obtenir des effets aléatoires groupés pour lmer après une imputation multiple? J'utilise des souris pour imputer plusieurs trames de données. Et lme4 pour un modèle mixte avec interception aléatoire et pente aléatoire. La mise en commun de lmer se passe bien, sauf qu'elle ne regroupe pas les effets …
Intro J'ai des participants qui touchent à plusieurs reprises des surfaces contaminées avec E. coli dans deux conditions ( A = porter des gants, B = pas de gants). Je veux savoir s'il y a une différence entre la quantité de bactéries au bout de leurs doigts avec et sans …
L'occurrence pas si rare lorsqu'il s'agit de modèles mixtes maximaux complexes (estimation de tous les effets aléatoires possibles pour des données et un modèle donnés) est parfaite (+1 ou -1) ou une corrélation presque parfaite entre certains effets aléatoires. Aux fins de la discussion, observons le modèle et le résumé …
J'ai des questions concernant la spécification et l'interprétation des GLMM. 3 questions sont définitivement statistiques et 2 sont plus spécifiquement sur R. Je poste ici parce que finalement je pense que le problème est l'interprétation des résultats GLMM. J'essaie actuellement d'installer un GLMM. J'utilise les données du recensement américain de …
J'adapte un modèle d'effets mixtes avec un terme spline dans une application où la tendance dans le temps est connue pour être curvi-linéaire. Cependant, ce que je voudrais évaluer, c'est si la tendance curvilinéaire se produit en raison de la déviation individuelle de la linéarité, ou est-ce un effet au …
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