Statistiques et Big Data r

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J'avais une question sur l'interprétation des graphiques générés par plot (lm) dans R. Je me demandais si vous pouviez me dire comment interpréter les tracés de localisation d'échelle et d'effet résiduel? Tous les commentaires seraient appréciés. Assumer des connaissances de base en statistique, régression et économétrie.

89 r regression data-visualization residuals outliers

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Effets aléatoires croisés et imbriqués: en quoi diffèrent-ils et comment sont-ils spécifiés correctement dans lme4?

Voici comment j'ai compris les effets aléatoires imbriqués et croisés: Les effets aléatoires imbriqués se produisent lorsqu'un facteur de niveau inférieur apparaît uniquement dans un niveau particulier d'un facteur de niveau supérieur. Par exemple, les élèves dans les classes à un moment donné. En lme4pensant que nous représentons les effets …

88 r mixed-model multilevel-analysis lme4-nlme

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Quelle peur devrions-nous avoir à propos des avertissements de convergence dans lme4

Si nous ajustons un regard, nous pouvons recevoir un avertissement nous indiquant que le modèle a du mal à converger ... par exemple >Warning message: In checkConv(attr(opt, "derivs"), opt$par, ctrl = control$checkConv, : Model failed to converge with max|grad| = 0.00389462 (tol = 0.001) Une autre façon de vérifier la …

88 r mixed-model lme4-nlme

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Qu'est-ce qu'une carence en rang et comment y remédier?

Une régression logistique à l'aide de lme4 se termine par Error in mer_finalize(ans) : Downdated X'X is not positive definite. Une cause probable de cette erreur est apparemment une insuffisance de rang. Qu'est-ce qu'une déficience de rang et comment devrais-je y remédier?

87 r logistic lme4-nlme

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Comment choisir la bibliothèque nlme ou lme4 R pour les modèles à effets mixtes?

Je s'adapter quelques modèles à effets mixtes ( en particulier les modèles longitudinaux) en utilisant lme4dans Rmais je voudrais vraiment maîtriser les modèles et le code qui va avec eux. Cependant, avant de plonger avec les deux pieds (et d'acheter des livres), je veux être sûr d'apprendre la bonne bibliothèque. …

85 r mixed-model lme4-nlme

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Ressources gratuites pour apprendre R

Je suis intéressé à apprendre R pour pas cher. Quelle est la meilleure ressource gratuite / livre / tutoriel pour apprendre R?

78 r references

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Un exemple: régression LASSO utilisant glmnet pour les résultats binaires

Je commence à me familiariser avec l’utilisation de glmnetavec LASSO Regression, où mon résultat d’intérêt est dichotomique. J'ai créé un petit cadre de données fictif ci-dessous: age <- c(4, 8, 7, 12, 6, 9, 10, 14, 7) gender <- c(1, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0) bmi_p <- …

78 r self-study lasso regression interpretation anova statistical-significance survey conditional-probability independence naive-bayes graphical-model r time-series forecasting arima r forecasting exponential-smoothing bootstrap outliers r regression poisson-distribution zero-inflation genetic-algorithms machine-learning feature-selection cart categorical-data interpretation descriptive-statistics variance multivariate-analysis covariance-matrix r data-visualization generalized-linear-model binomial proportion pca matlab svd time-series correlation spss arima chi-squared curve-fitting text-mining zipf probability categorical-data distance group-differences bhattacharyya regression variance mean data-visualization variance clustering r standard-error association-measure somers-d normal-distribution integral numerical-integration bayesian clustering python pymc nonparametric-bayes machine-learning svm kernel-trick hyperparameter poisson-distribution mean continuous-data univariate missing-data dag python likelihood dirichlet-distribution r anova hypothesis-testing statistical-significance p-value rating data-imputation censoring threshold

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Quelle est la meilleure façon de présenter une forêt au hasard dans une publication?

J'utilise l'algorithme de forêt aléatoire en tant que classificateur robuste de deux groupes dans une étude de microréseau comportant des milliers d'éléments. Quelle est la meilleure façon de présenter la forêt aléatoire de manière à ce qu'il y ait suffisamment d'informations pour la rendre reproductible dans un document? Existe-t-il une …

75 r machine-learning classification random-forest microarray

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Méthodes de rééchantillonnage / simulation: monte carlo, bootstrapping, jackknifing, validation croisée, tests de randomisation et tests de permutation

J'essaie de comprendre la différence entre différentes méthodes de rééchantillonnage (simulation de Monte Carlo, amorçage paramétrique, amorçage non paramétrique, jackknifing, validation croisée, tests de randomisation et de permutation) et leur mise en œuvre dans mon propre contexte en utilisant R. Disons que j'ai la situation suivante - je veux effectuer …

75 r bootstrap resampling jackknife permutation-test

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Bonne interface graphique pour R appropriée pour un débutant qui veut apprendre la programmation en R?

Existe-t-il une interface graphique pour R facilitant l’apprentissage et la programmation dans ce langage pour un débutant?

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Suppression du cadre de données de lignes en double dans R [fermé]

Comment puis-je supprimer les lignes en double de cet exemple de cadre de données? A 1 A 1 A 2 B 4 B 1 B 1 C 2 C 2 Je voudrais supprimer les doublons basés sur les deux colonnes: A 1 A 2 B 4 B 1 C 2 …

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Compléter des exemples concrets de recherches reproductibles utilisant R

La question: Existe-t-il de bons exemples de recherche reproductible utilisant R qui sont disponibles gratuitement en ligne? Exemple idéal: Plus précisément, des exemples idéaux fourniraient: Les données brutes (et idéalement les métadonnées expliquant les données), Tout le code R, y compris l’importation, le traitement, les analyses et la production de …

71 r references reproducible-research

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Générer une variable aléatoire avec une corrélation définie avec une ou plusieurs variables existantes

Pour une étude de simulation , je dois générer des variables aléatoires qui montrent une corrélation prefined (population) à une variable existante .YYY J'ai examiné les Rpackages copulaet ceux CDVinequi peuvent produire des distributions multivariées aléatoires avec une structure de dépendance donnée. Cependant, il n'est pas possible de fixer l'une …

71 r correlation random-variable random-generation independence assumptions random-variable unbiased-estimator regression hypothesis-testing heteroscedasticity generalized-least-squares distributions networks data-visualization sas reproducible-research philosophical time-series variance outliers quality-control mean multilevel-analysis average weighted-mean regression confidence-interval prediction-interval correlation matlab matrix data-mining maximum-likelihood r time-series survival predictive-models

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Quelle est la différence entre les fonctions R prcomp et princomp?

J'ai comparé ?prcompet ?princomptrouvé quelque chose à propos de l'analyse en composantes principales (ACP) en mode Q et en mode R. Mais honnêtement, je ne comprends pas. Quelqu'un peut-il expliquer la différence et peut-être même expliquer quand appliquer laquelle?

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Régression multiple multivariée dans R

J'ai 2 variables dépendantes (DV) dont chacune des notes peut être influencée par l'ensemble des 7 variables indépendantes (IV). Les DV sont continus, alors que l'ensemble des IV consiste en un mélange de variables codées continues et binaires. (Dans le code ci-dessous, les variables continues sont écrites en majuscules et …

68 r multivariate-analysis manova multiple-regression multivariate-regression

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