Les modèles mixtes (ou multiniveaux ou hiérarchiques) sont des modèles linéaires qui incluent à la fois des effets fixes et des effets aléatoires. Ils sont utilisés pour modéliser des données longitudinales ou imbriquées.
J'ai utilisé le MCMCglmmpackage récemment. Je suis confus par ce que l'on appelle dans la documentation structure R et structure G. Ceux-ci semblent se rapporter aux effets aléatoires - en particulier en spécifiant les paramètres de la distribution antérieure sur eux, mais la discussion dans la documentation semble supposer que …
Bonjour gourous statistiques et assistants de programmation R, Je m'intéresse à la modélisation des captures d'animaux en fonction des conditions environnementales et du jour de l'année. Dans le cadre d'une autre étude, j'ai dénombré des captures sur environ 160 jours sur trois ans. Chaque jour, j'ai la température, les précipitations, …
Diverses descriptions sur la sélection des modèles sur les effets aléatoires des modèles mixtes linéaires indiquent l'utilisation de REML. Je connais la différence entre REML et ML à un certain niveau, mais je ne comprends pas pourquoi REML devrait être utilisé parce que ML est biaisé. Par exemple, est-ce mal …
Étant donné une variable prédite (P), un effet aléatoire (R) et un effet fixe (F), on pourrait adapter deux * modèles à effets mixtes ( syntaxe lme4 ): m1 = lmer( P ~ (1|R) + F ) m2 = lmer( P ~ (1+F|R) + F) Si je comprends bien, le …
Disons que nous avons un modèle mod <- Y ~ X*Condition + (X*Condition|subject) # Y = logit variable # X = continuous variable # Condition = values A and B, dummy coded; the design is repeated # so all participants go through both Conditions # subject = random effects for …
J'ai lu à plusieurs reprises que les effets aléatoires (BLUP / modes conditionnels pour, disons, les sujets) ne sont pas des paramètres d'un modèle linéaire à effets mixtes mais peuvent être dérivés des paramètres de variance / covariance estimés. Par exemple, Reinhold Kliegl et al. (2011) indiquent: Les effets aléatoires …
J'essaie d'utiliser lme4::glmer()pour adapter un modèle mixte généralisé binomial (GLMM) avec une variable dépendante qui n'est pas binaire, mais une variable continue entre zéro et un. On peut considérer cette variable comme une probabilité; en fait , il est probable que rapporté par des sujets humains (dans une expérience que …
La question du CV J'essaie de donner (a) une représentation mathématique détaillée et concise d'un modèle à effets mixtes. J'utilise le lme4package dans R. Quelle est la représentation mathématique correcte pour mon modèle? Les données, la question scientifique et le code R Mon ensemble de données comprend des espèces dans …
Dans un modèle à effets mixtes, la recommandation consiste à utiliser un effet fixe pour estimer un paramètre si tous les niveaux possibles sont inclus (par exemple, hommes et femmes). Il est en outre recommandé d'utiliser un effet aléatoire pour tenir compte d'une variable si les niveaux inclus ne sont …
Les tests de permutation (également appelés test de randomisation, test de re-randomisation ou test exact) sont très utiles et s'avèrent utiles lorsque l'hypothèse de distribution normale requise par exemple t-testn'est pas remplie et lorsque la transformation des valeurs par classement des un test non paramétrique comme Mann-Whitney-U-testcela entraînerait la perte …
L'un des problèmes que j'ai toujours eu avec les modèles mixtes est de trouver des visualisations de données - du type qui pourraient se retrouver sur un papier ou une affiche - une fois que l'on a les résultats. En ce moment, je travaille sur un modèle d'effets mixtes de …
J'ai une question concernant l'utilisation d'une variable de regroupement dans un modèle non linéaire. Étant donné que la fonction nls () ne permet pas les variables de facteur, j'ai du mal à déterminer si l'on peut tester l'effet d'un facteur sur l'ajustement du modèle. J'ai inclus un exemple ci-dessous où …
Je connais assez bien les modèles à effets mixtes (MEM), mais un collègue m'a récemment demandé comment ils se comparent aux modèles de croissance latente (LGM). J'ai fait un peu de recherche sur Google, et il semble que LGM soit une variante de la modélisation des équations structurelles qui est …
J'ai une expérience que je vais essayer de résumer ici. Imaginez que je lance trois pierres blanches devant vous et vous demande de juger de leur position. J'enregistre une variété de propriétés des pierres et votre réponse. Je le fais sur un certain nombre de sujets. Je génère deux modèles. …
Je voudrais faire correspondre les sorties de lmer (vraiment glmer) avec un exemple binomial jouet. J'ai lu les vignettes et je crois comprendre ce qui se passe. Mais apparemment non. Après être resté coincé, j'ai corrigé la "vérité" en termes d'effets aléatoires et je suis allé après l'estimation des effets …
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