Questions marquées «lme4-nlme»

lme4 et nlme sont des packages R utilisés pour ajuster des modèles d'effets mixtes linéaires, linéaires généralisés et non linéaires. Pour les questions générales sur les modèles mixtes, utilisez la balise [mixed-model].


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Comment puis-je adapter un modèle à plusieurs niveaux pour les résultats de poissons trop dispersés?
Je veux adapter un GLMM à plusieurs niveaux avec une distribution de Poisson (avec sur-dispersion) en utilisant R. En ce moment j'utilise lme4 mais j'ai remarqué que récemment la quasipoissonfamille a été supprimée. J'ai vu ailleurs que vous pouvez modéliser une surdispersion additive pour les distributions binomiales en ajoutant une …


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comparaison lme et lmer
Je me demandais si quelqu'un pouvait m'éclairer sur les différences actuelles entre ces deux fonctions. J'ai trouvé la question suivante: Comment choisir la bibliothèque nlme ou lme4 R pour les modèles d'effets mixtes? , mais cela remonte à quelques années. C'est toute une vie dans les cercles logiciels. Mes questions …

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Comment obtenir une valeur de p et une taille d'effet «globales» pour un facteur catégoriel dans un modèle mixte (lme4)?
Je voudrais obtenir une valeur de p et une taille d'effet d'une variable catégorielle indépendante (avec plusieurs niveaux) - c'est-à-dire "global" et pas pour chaque niveau séparément, tout comme la sortie normale de lme4dans R. C'est comme la chose que les gens rapportent lorsqu'ils exécutent une ANOVA. Comment puis-je l'obtenir?

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Exemples de rapports pour l'analyse de modèles mixtes utilisant lmer en biologie, psychologie et médecine?
Comme le consensus général semble être d'utiliser des modèles mixtes via lmer()en R au lieu de l'ANOVA classique (pour les raisons souvent citées, comme les conceptions déséquilibrées, les effets aléatoires croisés, etc.), je voudrais essayer avec mes données. Cependant, je crains de pouvoir "vendre" cette approche à mon superviseur (qui …

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Dans un modèle à plusieurs niveaux, quelles sont les implications pratiques de l'estimation et de la non-estimation des paramètres de corrélation à effet aléatoire?
Dans un modèle à plusieurs niveaux, quelles sont les implications pratiques et liées à l'interprétation de l'estimation et de la non-estimation des paramètres de corrélation à effet aléatoire? La raison pratique de demander ceci est que dans le cadre de lmer dans R, il n'y a pas de méthode implémentée …

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L'AIC peut-il comparer différents types de modèles?
J'utilise AIC (Akaike's Information Criterion) pour comparer des modèles non linéaires dans R. Est-il valide de comparer les AIC de différents types de modèle? Plus précisément, je compare un modèle ajusté par glm avec un modèle avec un terme à effet aléatoire ajusté par glmer (lme4). Sinon, existe-t-il un moyen …

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Fonction Predict () pour les modèles d'effets mixtes lmer
Le problème: J'ai lu dans d'autres articles qui predictne sont pas disponibles pour les lmermodèles d' effets mixtes {lme4} dans [R]. J'ai essayé d'explorer ce sujet avec un jeu de données jouet ... Contexte: L'ensemble de données est adapté de cette source et disponible en ... require(gsheet) data <- read.csv(text …



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Ai-je correctement spécifié mon modèle dans lmer?
J'ai parcouru de nombreux sites d'aide et je ne sais toujours pas comment spécifier des termes imbriqués plus compliqués dans un modèle mixte. Je suis également confus en ce qui concerne l'utilisation de :et /et |en spécifiant les interactions et l'imbrication avec des facteurs aléatoires à l'aide lmer()du lme4package dans …




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