Les modèles mixtes (ou multiniveaux ou hiérarchiques) sont des modèles linéaires qui incluent à la fois des effets fixes et des effets aléatoires. Ils sont utilisés pour modéliser des données longitudinales ou imbriquées.
J'essaie de passer de l'utilisation du ezpackage à lmedes mesures répétées ANOVA (car j'espère que je pourrai utiliser des contrastes personnalisés avec lme). En suivant les conseils de ce billet de blog, j'ai pu configurer le même modèle en utilisant à la fois aov(comme le fait ez, sur demande) et …
J'ai regardé à travers cet aperçu des formules lm / lmer R par @conjugateprior et je suis devenu confus par l'entrée suivante: Supposons maintenant que A est aléatoire, mais B est fixe et B est imbriqué dans A. aov(Y ~ B + Error(A/B), data=d) Ci-dessous, une formule de modèle mixte …
Je me demande s'il existe des méthodes pour calculer la taille de l'échantillon dans les modèles mixtes? J'utilise lmeren R pour ajuster les modèles (j'ai des pentes et des interceptions aléatoires).
Comment les modèles d'effets mixtes (linéaires) sont-ils normalement comparés les uns aux autres? Je sais que des tests de rapport de vraisemblance peuvent être utilisés, mais cela ne fonctionne pas si un modèle n'est pas un «sous-ensemble» de l'autre correct? L'estimation des modèles df est-elle toujours simple? Nombre d'effets fixes …
Nous avons exécuté une régression logistique à effets mixtes en utilisant la syntaxe suivante; # fit model fm0 <- glmer(GoalEncoding ~ 1 + Group + (1|Subject) + (1|Item), exp0, family = binomial(link="logit")) # model output summary(fm0) Le sujet et l'objet sont les effets aléatoires. Nous obtenons un résultat étrange qui …
Lors d'une conférence, j'ai entendu la déclaration suivante: 100 mesures pour 5 sujets fournissent beaucoup moins d'informations que 5 mesures pour 100 sujets. C'est un peu évident que c'est vrai, mais je me demandais comment on pouvait le prouver mathématiquement ... Je pense qu'un modèle mixte linéaire pourrait être utilisé. …
J'ai une expérience à mesures répétées où la variable dépendante est un pourcentage et j'ai plusieurs facteurs comme variables indépendantes. Je voudrais utiliser à glmerpartir du package R lme4pour le traiter comme un problème de régression logistique (en spécifiant family=binomial) car il semble s'adapter directement à cette configuration. Mes données …
Je me suis récemment lancé dans l'ajustement de modèles mixtes de régression dans le cadre bayésien, en utilisant un algorithme MCMC (fonction MCMCglmm dans R en fait). Je crois avoir compris comment diagnostiquer la convergence du processus d'estimation (trace, tracé de geweke, autocorrélation, distribution postérieure ...). L'une des choses qui …
J'ai exécuté un modèle mixte linéaire généralisé dans R et inclus un effet d'interaction entre deux prédicteurs. L'interaction n'était pas significative, mais les principaux effets (les deux prédicteurs) l'étaient tous les deux. Maintenant, de nombreux exemples de manuels me disent que s'il y a un effet significatif de l'interaction, les …
Après avoir effectué l'analyse des composants principaux (PCA), je souhaite projeter un nouveau vecteur sur l'espace PCA (c'est-à-dire trouver ses coordonnées dans le système de coordonnées PCA). J'ai calculé PCA en langage R en utilisant prcomp. Maintenant, je devrais pouvoir multiplier mon vecteur par la matrice de rotation PCA. Les …
Avec l'ensemble de données suivant, je voulais voir si la réponse (effet) change en ce qui concerne les sites, la saison, la durée et leurs interactions. Certains forums en ligne sur les statistiques m'ont suggéré de continuer avec les modèles à effets mixtes linéaires, mais le problème est que, puisque …
J'ai travaillé avec certaines données qui ont des problèmes avec les mesures répétées. Ce faisant, j'ai remarqué un comportement très différent entre lme()et en lmer()utilisant mes données de test et je veux savoir pourquoi. Le faux ensemble de données que j'ai créé contient des mesures de taille et de poids …
Je comprends que la différence entre eux est liée au fait que la variable de regroupement dans le modèle est estimée comme un effet fixe ou aléatoire, mais je ne comprends pas pourquoi elles ne sont pas les mêmes (si elles ne sont pas les mêmes). Je suis particulièrement intéressé …
Une collègue analyse certaines données biologiques pour sa thèse avec une mauvaise hétéroscédasticité (figure ci-dessous). Elle est en train de l'analyser avec un modèle mixte mais a toujours des problèmes avec les résidus. La transformation logarithmique des variables de réponse nettoie les choses et sur la base des commentaires sur …
J'ai utilisé l'imputation multiple pour obtenir un certain nombre de jeux de données terminés. J'ai utilisé des méthodes bayésiennes sur chacun des ensembles de données terminés pour obtenir des distributions postérieures pour un paramètre (un effet aléatoire). Comment puis-je combiner / regrouper les résultats de ce paramètre? Plus de contexte: …
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