Signale les situations où l'on est préoccupé par la réalisation de la puissance et de la taille voulues lorsque plus d'un test d'hypothèse est effectué.
Nous savons que nous devons appliquer des corrections de type Benjamini Hochberg pour les tests d'hypothèses multiples aux expériences basées sur un seul ensemble de données, afin de contrôler le taux de fausses découvertes, sinon toutes les expériences qui donnent un résultat positif pourraient être fausses. Mais pourquoi n'appliquons-nous pas …
J'ai des valeurs de p provenant de nombreux tests et j'aimerais savoir s'il y a réellement quelque chose d'important après correction pour plusieurs tests. La complication: mes tests ne sont pas indépendants. La méthode à laquelle je pense (une variante de la méthode des produits de Fisher, Zaykin et al., …
J'ai lu l'article suivant: Perneger (1998) Qu'est-ce qui ne va pas avec les ajustements de Bonferroni . L'auteur a résumé en disant que l'ajustement de Bonferroni a, au mieux, des applications limitées dans la recherche biomédicale et ne devrait pas être utilisé lors de l'évaluation des preuves d'une hypothèse spécifique: …
J'utilise JMP pour examiner les différences de couverture végétale dans les groupes de formes de croissance (arbres, arbustes, forbes, etc.) avant et après trois traitements avec un témoin. Ma taille d'échantillon est petite (n = 5) et la plupart de mes distributions ne sont pas normalement distribuées. Pour les distributions …
Andrew Gelman a écrit un article détaillé sur les raisons pour lesquelles les tests bayésiens AB ne nécessitent pas de correction d'hypothèses multiples: pourquoi nous n'avons (habituellement) pas à nous inquiéter des comparaisons multiples , 2012. Je ne comprends pas très bien: pourquoi les méthodes bayésiennes ne nécessitent-elles pas plusieurs …
J'effectue tests statistiques indépendants avec la même hypothèse nulle et je voudrais combiner les résultats en une seule valeur . Il semble qu'il existe deux méthodes "acceptées": la méthode de Fisher et la méthode de Stouffer .NNNppp Ma question concerne la méthode de Stouffer. Pour chaque test séparé, j'obtiens un …
Lorsque nous effectuons des expériences (sur de petits échantillons (généralement la taille de l'échantillon par groupe de traitement est d'environ 7 à 8)) sur deux groupes, nous utilisons un test t pour tester la différence. Cependant, lorsque nous effectuons une ANOVA (évidemment pour plus de deux groupes), nous utilisons quelque …
J'ai deux questions concernant le moment d'utiliser un ajustement Bonferroni: Est-il approprié d'utiliser un ajustement Bonferroni dans tous les cas de tests multiples? Si l'on effectue un test sur un ensemble de données, alors on divise cet ensemble de données en niveaux plus fins (par exemple, divise les données par …
Après avoir effectué l'analyse des composants principaux (PCA), je souhaite projeter un nouveau vecteur sur l'espace PCA (c'est-à-dire trouver ses coordonnées dans le système de coordonnées PCA). J'ai calculé PCA en langage R en utilisant prcomp. Maintenant, je devrais pouvoir multiplier mon vecteur par la matrice de rotation PCA. Les …
J'examine un article qui a effectué> 15 tests distincts du Chi2 2x2. J'ai suggéré qu'ils doivent corriger les comparaisons multiples, mais ils ont répondu en disant que toutes les comparaisons étaient prévues, et donc ce n'est pas nécessaire. Je pense que cela ne doit pas être correct, mais je ne …
Quelle est la méthode préférée pour effectuer des post-hocs pour les tests intra-sujets? J'ai vu des travaux publiés où le HSD de Tukey est utilisé, mais un examen de Keppel et Maxwell & Delaney suggère que la violation probable de la sphéricité dans ces conceptions rend le terme d'erreur incorrect …
J'ai entendu dire que lorsque de nombreuses spécifications de modèle de régression (par exemple, dans OLS) sont considérées comme des possibilités pour un ensemble de données, cela pose de multiples problèmes de comparaison et les valeurs de p et les intervalles de confiance ne sont plus fiables. Un exemple extrême …
J'ai lu ce grand article de David Colquhoun: Une enquête sur le taux de fausses découvertes et la mauvaise interprétation des valeurs de p (2014). En substance, il explique pourquoi le taux de fausses découvertes (FDR) peut atteindre même si nous contrôlons l'erreur de type I avec .30%30%30\%α=0.05α=0.05\alpha=0.05 Cependant, je …
Dans quelle mesure la correction de tests multiples de Benjamini-Hochberg est-elle conservatrice par rapport au nombre total de comparaisons? Par exemple, si j'ai une liste de 18 000 fonctionnalités pour deux groupes et que j'effectue un test de Wilcoxon pour obtenir une valeur de p. J'ajuste cette valeur de p …
C'est un exercice donné dans Probability Theory: The Logic of Science par Edwin Jaynes, 2003. Il y a une solution partielle ici . J'ai élaboré une solution partielle plus générale et je me demandais si quelqu'un d'autre l'avait résolue. J'attendrai un peu avant de poster ma réponse, pour essayer les …
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