Science computationnelle

7

Alternatives à Journal of Computational Physics

Le Journal of Computational Physics a été un débouché important pour la science informatique dans le passé, et j'y ai déjà publié. Pour le bénéfice de ceux (comme moi) qui ont signé le boycott d'Elsevier , quelles revues non Elsevier seraient des endroits appropriés pour publier des articles qui auraient …

29 publications

9

Quelle est la bonne façon d'exécuter des études de paramètres en C ++

Le problème Je travaille actuellement sur une simulation d'élément fini Navier Stokes et j'aimerais étudier les effets d'une variété de paramètres. Certains paramètres sont spécifiés dans un fichier d'entrée ou via une option de ligne de commande; d'autres paramètres sont fournis sous forme d'indicateurs dans un Makefile, mon code doit …

29 software finite-element python c++

7

Où les lois de la mécanique quantique se décomposent-elles dans les simulations?

En tant que titulaire d'un BA en physique, j'ai été quelque peu scandalisé lorsque j'ai commencé à travailler avec des simulations moléculaires. Ce fut un peu un choc de découvrir que même les simulations les plus détaillées et les plus coûteuses en calcul ne peuvent pas reproduire quantitativement le comportement …

29 quantum-mechanics simulation

16

De bons exemples de «deux, c'est facile, trois, c'est difficile» en sciences informatiques

J'ai récemment rencontré une formulation du méta-phénomène : " deux c'est facile, trois c'est dur " (formulé de cette façon par Federico Poloni), qui peut être décrit comme suit: Lorsqu'un certain problème est formulé pour deux entités, il est relativement facile à résoudre; cependant, un algorithme pour une formulation à …

29 linear-algebra computational-physics computational-geometry computational-chemistry

2

Un minuscule déterminant implique-t-il un mauvais conditionnement d'une matrice?

Si j'ai une matrice inversible carrée et que je prends son déterminant, et que je trouve que , cela implique-t-il que la matrice est mal conditionnée?det(A)≈0det(A)≈0\det(A) \approx 0 L'inverse est-il également vrai? Une matrice mal conditionnée a-t-elle un déterminant presque nul? Voici quelque chose que j'ai essayé dans Octave: a …

29 linear-algebra condition-number

5

De quelles fonctionnalités les utilisateurs ont-ils besoin d'une interface MPI C ++?

Voulez-vous améliorer ce post? Fournissez des réponses détaillées à cette question, y compris des citations et une explication de la raison pour laquelle votre réponse est correcte. Les réponses sans suffisamment de détails peuvent être modifiées ou supprimées. La version 3.0 de la norme MPI a officiellement supprimé l'interface C …

28 c++ mpi

4

Traiter l'inverse d'une matrice symétrique définie positive (covariance)?

En statistique et ses diverses applications, nous calculons souvent la matrice de covariance , qui est définie positive (dans les cas considérés) et symétrique, pour différentes utilisations. Parfois, nous avons besoin de l'inverse de cette matrice pour divers calculs (formes quadratiques avec cet inverse comme (seule) matrice centrale, par exemple). …

27 linear-algebra matrix

7

Quelle est la façon la plus rapide de calculer la plus grande valeur propre d'une matrice générale?

EDIT: Je teste si des valeurs propres ont une magnitude de un ou plus. J'ai besoin de trouver la plus grande valeur propre absolue d'une grande matrice clairsemée et non symétrique. J'ai utilisé la eigen()fonction de R , qui utilise l'algo QR d'EISPACK ou de LAPACK pour trouver toutes les …

27 linear-algebra algorithms eigensystem sparse-matrix

5

Existe-t-il des problèmes / algorithmes célèbres dans le calcul scientifique qui ne peuvent pas être accélérés par la parallélisation

Cette question a été migrée à partir de Stack Overflow car il est possible d'y répondre sur Computational Science Stack Exchange. Migré il y a 7 ans . Existe-t-il des problèmes / algorithmes célèbres dans le calcul scientifique qui ne peuvent pas être accélérés par la parallélisation? Il me semble …

27 parallel-computing

8

Quel paquet dois-je utiliser pour envelopper le code Fortran moderne avec Python?

Je connais et j'ai utilisé f2py2e pour envelopper un ancien code Fortran 77, mais je crois comprendre que cela ne fonctionne pas avec le code Fortran 95 plus récent. J'ai recherché ce que je devrais utiliser, et j'ai rencontré fwrap et G3 f2py, qui ne semblent pas donner d'explication sur …

27 python fortran

5

Permutez une matrice en place dans numpy

Je veux modifier une matrice de transition carrée dense en place en changeant l'ordre de plusieurs de ses lignes et colonnes, en utilisant la bibliothèque numpy de python. Mathématiquement, cela correspond à la pré-multiplication de la matrice par la matrice de permutation P et à la post-multiplication par P ^ …

27 linear-algebra python numpy

3

Quelle est la relation entre BLAS, LAPACK et d'autres bibliothèques d'algèbre linéaire?

J'ai étudié les bibliothèques d'algèbre linéaire C ++ pour un projet sur lequel je travaillais. Quelque chose que je n'ai pas encore saisi est la connexion de BLAS et LAPACK à d'autres bibliothèques d'algèbre linéaire. En parcourant cet article sur les bibliothèques d'algèbre linéaire, j'ai trouvé intéressant que: certaines bibliothèques …

26 linear-algebra software lapack blas

2

Crank-Nicolson est-il un schéma de discrétisation stable pour l'équation de réaction-diffusion-advection (convection)?

Je ne connais pas très bien les schémas de discrétisation courants pour les PDE. Je sais que Crank-Nicolson est un schéma populaire pour discrétiser l'équation de diffusion. Est également un bon choix pour le terme d'advection? Je suis intéressé par la résolution de l'équation Réaction-Diffusion-Advection , ∂u∂t+∇⋅(vu−D∇u)=f∂u∂t+∇⋅(vu−D∇u)=f\frac{\partial u}{\partial t} + …

26 pde discretization advection diffusion

3

Comment tester une implémentation de solveur numérique ODE?

Cette question a été migrée à partir de Mathematics Stack Exchange car il est possible d'y répondre sur Computational Science Stack Exchange. Migré il y a 6 ans . Je suis sur le point de commencer à travailler sur une bibliothèque de logiciels de solveurs numériques ODE , et je …

26 ode

5

Bibliothèques de triangulation Delaunay les plus rapides pour les ensembles de points 3D

Quelle est la bibliothèque la plus rapide pour effectuer une triangulation delaunay d'ensembles avec des millions de points 3D? Existe-t-il également des versions GPU? De l'autre côté, avoir la tessellation voronoi du même ensemble de points, aiderait (en termes de performances) à obtenir la triangulation delaunay?

26 computational-geometry delaunay-triangulation voronoi-diagrams