Statistiques et Big Data r

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Régression logistique: Scikit Learn vs glmnet

J'essaie de dupliquer les résultats de sklearnla bibliothèque de régression logistique en utilisant le glmnetpackage dans R. À partir de la documentation desklearn régression logistique , il essaie de minimiser la fonction de coût sous pénalité l2 min w , c 1minw , c12wTw + C∑i = 1NJournal( exp( - …

15 r logistic python scikit-learn glmnet

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Un modèle de données non négatives avec agrégation de zéros (Tweedie GLM, zéro gonflé GLM, etc.) peut-il prédire des zéros exacts?

Une distribution de Tweedie peut modéliser des données asymétriques avec une masse ponctuelle à zéro lorsque le paramètre (exposant dans la relation moyenne-variance) est compris entre 1 et 2.ppp De même, un modèle gonflé à zéro (qu'il soit par ailleurs continu ou discret) peut avoir un grand nombre de zéros. …

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Quelle mesure d'erreur de formation signaler pour les forêts aléatoires?

Je prépare actuellement des forêts aléatoires pour un problème de classification en utilisant le randomForestpackage dans R, et je ne sais pas comment signaler une erreur de formation pour ces modèles. Mon erreur d'entraînement est proche de 0% lorsque je la calcule en utilisant les prédictions que j'obtiens avec la …

15 r machine-learning classification random-forest overfitting

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J'ai une ligne de meilleur ajustement. J'ai besoin de points de données qui ne changeront pas ma ligne de meilleur ajustement

Je fais une présentation sur l'ajustement des lignes. J'ai une fonction linéaire simple, . J'essaie d'obtenir des points de données dispersées que je peux mettre dans un nuage de points qui maintiendra ma ligne de meilleur ajustement dans la même équation.y=1x+by=1x+by=1x+b Je serais ravi d'apprendre cette technique dans R ou …

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Séries chronologiques biologiques multivariées: VAR et saisonnalité

J'ai un ensemble de données de séries chronologiques multivariées comprenant des variables biologiques et environnementales en interaction (plus éventuellement des variables exogènes). Outre la saisonnalité, il n'y a pas de tendance claire à long terme dans les données. Mon but est de voir quelles variables sont liées les unes aux …

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Pourquoi ne puis-je pas faire correspondre la sortie glmer (famille = binomiale) avec l'implémentation manuelle de l'algorithme de Gauss-Newton?

Je voudrais faire correspondre les sorties de lmer (vraiment glmer) avec un exemple binomial jouet. J'ai lu les vignettes et je crois comprendre ce qui se passe. Mais apparemment non. Après être resté coincé, j'ai corrigé la "vérité" en termes d'effets aléatoires et je suis allé après l'estimation des effets …

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Meilleure façon de présenter visuellement des relations à partir d'un modèle linéaire multiple

J'ai un modèle linéaire avec environ 6 prédicteurs et je vais présenter les estimations, les valeurs F, les valeurs p, etc. Cependant, je me demandais quel serait le meilleur tracé visuel pour représenter l'effet individuel d'un seul prédicteur sur la variable de réponse? Scatterplot? Tracé conditionnel? Tracé d'effets? etc? Comment …

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Statistiques de Ljung-Box pour les résidus ARIMA dans R: résultats de tests confus

J'ai une série chronologique que j'essaie de prévoir, pour laquelle j'ai utilisé le modèle saisonnier ARIMA (0,0,0) (0,1,0) [12] (= fit2). C'est différent de ce que R a suggéré avec auto.arima (R calculé ARIMA (0,1,1) (0,1,0) [12] serait un meilleur ajustement, je l'ai nommé fit1). Cependant, au cours des 12 …

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Comment faire une régression avec un codage d'effet au lieu d'un codage factice dans R?

Je travaille actuellement sur un modèle de régression où je n'ai que des variables catégorielles / factorielles comme variables indépendantes. Ma variable dépendante est un rapport transformé logit. Il est assez facile d'exécuter une régression normale dans R, car R sait automatiquement coder les nuls dès qu'ils sont du type …

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Recherche d'extrêmes locaux d'une fonction de densité à l'aide de splines

J'essaie de trouver les maxima locaux pour une fonction de densité de probabilité (trouvée en utilisant la densityméthode de R ). Je ne peux pas faire une simple méthode "regarder autour des voisins" (où l'on regarde autour d'un point pour voir s'il s'agit d'un maximum local par rapport à ses …

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Mise à jour efficace de la régression linéaire lors de l'ajout d'observations et / ou de prédicteurs dans R

Je serais intéressé à trouver des moyens dans R pour mettre à jour efficacement un modèle linéaire lorsqu'une observation ou un prédicteur est ajouté. biglm a une capacité de mise à jour lors de l'ajout d'observations, mais mes données sont suffisamment petites pour résider en mémoire (même si j'ai un …

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Comprendre le décalage k dans le test Dickey Fuller augmenté de R

J'ai joué avec des tests de racine unitaire en R et je ne sais pas trop quoi faire du paramètre k lag. J'ai utilisé le test Dickey Fuller augmenté et le test Philipps Perron du package tseries . Évidemment, le paramètre par défaut (pour le ) ne dépend que de …

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Qu'est-ce que la «ligne de base» dans la courbe de rappel de précision

J'essaie de comprendre la courbe de rappel de précision, je comprends ce que sont la précision et le rappel, mais ce que je ne comprends pas, c'est la valeur "de base". Je lisais ce lien https://classeval.wordpress.com/introduction/introduction-to-the-precision-recall-plot/ et je ne comprends pas la partie de la ligne de base comme indiqué …

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Quelle méthode de comparaison multiple utiliser pour un modèle lmer: lsmeans ou glht?

J'analyse un ensemble de données à l'aide d'un modèle à effets mixtes avec un effet fixe (condition) et deux effets aléatoires (participant en raison de la conception et de la paire du sujet). Le modèle a été généré avec le lme4package: exp.model<-lmer(outcome~condition+(1|participant)+(1|pair),data=exp). Ensuite, j'ai effectué un test de rapport de …

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Tester si les distributions multidimensionnelles sont les mêmes

Disons que j'ai deux ou plusieurs populations d'échantillons de vecteurs à valeurs continues à n dimensions. Existe-t-il un moyen non paramétrique de tester si ces échantillons proviennent de la même distribution? Si oui, existe-t-il une fonction en R ou en python pour cela?

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