Questions marquées «r»

Utilisez cette balise pour toute question * sur le sujet * qui (a) implique «R» en tant que partie critique de la question ou réponse attendue, et (b) n'est pas * seulement * sur la façon d'utiliser «R».

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Comment tester la surdispersion dans Poisson GLMM avec lmer () dans R?
J'ai le modèle suivant: > model1<-lmer(aph.remain~sMFS1+sAG1+sSHDI1+sbare+season+crop +(1|landscape),family=poisson) ... et voici la sortie récapitulative. > summary(model1) Generalized linear mixed model fit by the Laplace approximation Formula: aph.remain ~ sMFS1 + sAG1 + sSHDI1 + sbare + season + crop + (1 | landscape) AIC BIC logLik deviance 4057 4088 -2019 4039 …




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Comment calculer les «Chemins vers la Maison Blanche» en utilisant R?
Je viens de tomber sur cette grande analyse qui est à la fois intéressante et belle visuellement: http://www.nytimes.com/interactive/2012/11/02/us/politics/paths-to-the-white-house.html Je suis curieux de savoir comment un tel "arbre de chemin" peut être construit en utilisant R. De quelles données et algorithme a-t-on besoin pour construire un tel arbre de chemin? Merci.

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Désaisonnalisation des données de comptage
J'ai utilisé stl () dans R pour décomposer les données de comptage en composantes de tendance, saisonnières et irrégulières. Les valeurs de tendance résultantes ne sont plus des nombres entiers. J'ai les questions suivantes: Stl () est-il un moyen approprié de désaisonnaliser les données de comptage? Étant donné que la …


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Régression linéaire avec mesures répétées dans R
Je n'ai pas réussi à comprendre comment effectuer une régression linéaire dans R pour un plan de mesures répétées. Dans une question précédente (toujours sans réponse), il m'a été suggéré de ne pas utiliser lmmais plutôt d'utiliser des modèles mixtes. J'ai utilisé lmde la manière suivante: lm.velocity_vs_Velocity_response <- lm(Velocity_response~Velocity*Subject, data=mydata) …

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STL sur séries chronologiques avec valeurs manquantes pour la détection d'anomalies
J'essaie de détecter des valeurs anormales dans une série chronologique de données climatiques avec quelques observations manquantes. En cherchant sur le Web, j'ai trouvé de nombreuses approches disponibles. Parmi ceux-ci, la décomposition stl semble attrayante, dans le sens de supprimer les composantes de tendance et saisonnières et d'étudier le reste. …

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Pourquoi les décompositions propres et svd d'une matrice de covariance basées sur des données clairsemées donnent-elles des résultats différents?
J'essaie de décomposer une matrice de covariance basée sur un ensemble de données clairsemé / gappy. Je remarque que la somme de lambda (variance expliquée), telle que calculée avec svd, est amplifiée avec des données de plus en plus pertinentes. Sans lacunes, svdet eigenobtenez les mêmes résultats. Cela ne semble …
12 r  svd  eigenvalues 

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randomForest choisit la régression au lieu de la classification
J'utilise le package randomForest dans R et j'utilise les données d'iris, la forêt aléatoire générée est une classification mais lorsque j'utilise un ensemble de données avec environ 700 entités (les entités sont chaque pixel dans une image de 28 x 28 pixels) et la colonne d'étiquette est nommée label, le …
12 r  random-forest 


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Comment puis-je optimiser l'efficacité de calcul lors de l'adaptation répétée d'un modèle complexe à un grand ensemble de données?
J'ai des problèmes de performances en utilisant le MCMCglmmpackage dans R pour exécuter un modèle d'effets mixtes. Le code ressemble à ceci: MC1<-MCMCglmm(bull~1,random=~school,data=dt,family="categorical" , prior=list(R=list(V=1,fix=1), G=list(G1=list(V=1, nu=0))) , slice=T, nitt=iter, ,burnin=burn, verbose=F) Il y a environ 20 000 observations dans les données et elles sont regroupées dans environ 200 écoles. …

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Comment simuler des données fonctionnelles?
J'essaie de tester différentes approches d'analyse de données fonctionnelles. Idéalement, je voudrais tester le panel d'approches que j'ai sur des données fonctionnelles simulées. J'ai essayé de générer une FD simulée en utilisant une approche basée sur une sommation des bruits gaussiens (code ci-dessous), mais les courbes résultantes semblent beaucoup trop …

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Déterminer automatiquement la distribution de probabilité à partir d'un ensemble de données
Étant donné un ensemble de données: x <- c(4.9958942,5.9730174,9.8642732,11.5609671,10.1178216,6.6279774,9.2441754,9.9419299,13.4710469,6.0601435,8.2095239,7.9456672,12.7039825,7.4197810,9.5928275,8.2267352,2.8314614,11.5653497,6.0828073,11.3926117,10.5403929,14.9751607,11.7647580,8.2867261,10.0291522,7.7132033,6.3337642,14.6066222,11.3436587,11.2717791,10.8818323,8.0320657,6.7354041,9.1871676,13.4381778,7.4353197,8.9210043,10.2010750,11.9442048,11.0081195,4.3369520,13.2562675,15.9945674,8.7528248,14.4948086,14.3577443,6.7438382,9.1434984,15.4599419,13.1424011,7.0481925,7.4823108,10.5743730,6.4166006,11.8225244,8.9388744,10.3698150,10.3965596,13.5226492,16.0069239,6.1139247,11.0838351,9.1659242,7.9896031,10.7282936,14.2666492,13.6478802,10.6248561,15.3834373,11.5096033,14.5806570,10.7648690,5.3407430,7.7535042,7.1942866,9.8867927,12.7413156,10.8127809,8.1726772,8.3965665) .. Je voudrais déterminer la distribution de probabilité la plus appropriée (gamma, bêta, normale, exponentielle, poisson, chi carré, etc.) avec une estimation des paramètres. Je suis déjà au courant de la question sur le lien suivant, où une solution est fournie …

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