Les modèles mixtes (ou multiniveaux ou hiérarchiques) sont des modèles linéaires qui incluent à la fois des effets fixes et des effets aléatoires. Ils sont utilisés pour modéliser des données longitudinales ou imbriquées.
J'ai un ensemble de données assez compliqué à analyser, et je ne peux pas trouver une bonne solution pour cela. Voici la chose: 1. les données brutes sont essentiellement des enregistrements de chants d'insectes. Chaque chanson est composée de plusieurs rafales et chaque rafale est constituée de sous-unités. Tous les …
Mon collègue et moi ajustons une gamme de modèles d'effets mixtes linéaires et non linéaires dans R. On nous demande d'effectuer une validation croisée sur les modèles ajustés afin que l'on puisse vérifier que les effets observés sont relativement généralisables. C'est normalement une tâche triviale, mais dans notre cas, nous …
Cette question peut sembler stupide, mais ... est-il exact que les effets aléatoires ne peuvent s'appliquer qu'aux variables catégorielles (comme l'identifiant individuel, l'identifiant de la population, ...), par exemple, disons que est une variable catégorielle:xixix_i yiyiy_i ~βxiβxi\beta_{x_i} βxiβxi\beta_{x_i} ~Norm(μ,δ2)Norm(μ,δ2)Norm(\mu, \delta^2) mais d'après le principe, l' effet aléatoire ne peut pas …
On m'a demandé d'analyser certaines données d'un essai clinique à la recherche de deux méthodes de mesure de la pression artérielle. J'ai des données de 50 sujets, chacun avec entre 2 et 57 mesures utilisant chaque méthode. Je me demande comment procéder. Évidemment, j'ai besoin d'une solution qui tiendra compte …
Envisagez une expérience avec plusieurs participants humains, chacun mesuré plusieurs fois dans deux conditions. Un modèle d'effets mixtes peut être formulé (en utilisant la syntaxe lme4 ) comme: fit = lmer( formula = measure ~ (1|participant) + condition ) Supposons maintenant que je souhaite générer des intervalles de confiance bootstrap …
J'ai parcouru Google et ce site et je suis toujours confus à propos de la fonction lmer dans la bibliothèque lme4. J'ai quelques données recueillies auprès de différents services psychiatriques, qui ont une structure à plusieurs niveaux. Pour simplifier, je vais choisir deux variables de niveau 2 et deux de …
Je fais une étude de simulation qui nécessite des estimations d'amorçage obtenues à partir d'un modèle mixte linéaire généralisé (en fait, le produit de deux estimations pour les effets fixes, une à partir d'un GLMM et l'autre à partir d'un LMM). Pour bien faire l'étude, il faudrait environ 1000 simulations …
J'ai une question de base concernant les approches de la moyenne des modèles à l'aide de critères informatiques pour pondérer les modèles au sein d'un ensemble candidat. La plupart des sources que j'ai lues sur la moyenne du modèle préconisent de faire la moyenne des estimations des coefficients des paramètres …
Je simule des essais de Bernoulli avec un aléatoire entre les groupes, puis j'adapte le modèle correspondant avec le paquet:logitθ ∼ N( logitθ0,12)logitθ∼N(logitθ0,12)\text{logit}\, \theta \sim {\cal N}(\text{logit}\, \theta_0, 1^2)lme4 library(lme4) library(data.table) I <- 30 # number of groups J <- 10 # number of Bernoulli trials within each group logit …
La distinction entre les variables strictement aléatoires (qui devraient être modélisées en tant que telles) et les variables non aléatoires qui, selon certains, pourraient être modélisées comme aléatoires s'il s'agit d'un modèle hiérarchique / à plusieurs niveaux, est floue pour moi. Bates et Bolker illustrent les effets aléatoires avec des …
J'ai du mal à obtenir des résultats équivalents entre un aovmodèle de mesures répétées inter-intra et un lmermodèle mixte. Mes données et mon script se présentent comme suit data=read.csv("https://www.dropbox.com/s/zgle45tpyv5t781/fitness.csv?dl=1") data$id=factor(data$id) data id FITNESS TEST PULSE 1 1 pilates CYCLING 91 2 2 pilates CYCLING 82 3 3 pilates CYCLING 65 …
Dois-je inclure des effets aléatoires dans un modèle même s'ils ne sont pas statistiquement significatifs? J'ai un plan expérimental de mesures répétées, dans lequel chaque individu expérimente trois traitements différents dans un ordre aléatoire. Je voudrais contrôler les effets de l'individu et de l'ordre, mais aucun ne semble statistiquement significatif …
Je m'intéresse à la prévision Yet j'étudie deux techniques de mesure X1et X2. Il se pourrait, par exemple, que je veuille prédire la saveur d'une banane, soit en mesurant depuis combien de temps elle repose sur la table, soit en mesurant le nombre de taches brunes sur la banane. Je …
J'essaie de produire un modèle mixte linéaire, le code R est le suivant. lme (Average.payoff ~ Game + Type + Others.Type + Game: Type + Game: Others.Type + Type: Others.Type, random = ~ 1 | Subjects, method = "REML", data = Subjectsm1) -> lme1 Le terme de réponse Average.payoff est …
Dans R, comment spécifier le modèle lmer sans effet fixe global? Par exemple, si je dis quelque chose comme lmer(y ~ (1 | group) + (0 + x | group), data = my_df) le modèle équipé sera yje j= a +αje+βjeXje jyij=a+αi+βixijy_{ij} = a + \alpha_{i} + \beta_{i} x_{ij} Comment …
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