Unix & Linux join

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Comment fusionner deux fichiers en fonction de la correspondance de deux colonnes?

J'ai file1 aime: 0 AFFX-SNP-000541 NA 0 AFFX-SNP-002255 NA 1 rs12103 0.6401 1 rs12103_1247494 0.696 1 rs12142199 0.7672 Et un fichier2: 0 AFFX-SNP-000541 1 0 AFFX-SNP-002255 1 1 rs12103 0.5596 1 rs12103_1247494 0.5581 1 rs12142199 0.4931 Et voudrait un fichier3 tel que: 0 AFFX-SNP-000541 NA 1 0 AFFX-SNP-002255 NA 1 …

33 text-processing awk join bioinformatics

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join: "Fichier 2 non trié"

J'ai deux fichiers _jeter3.txt et _jeter1.txt J'ai vérifié qu'ils sont tous les deux triés sur la 20e colonne en utilisant sort -c sort -t ' ' -c -k20,20 _jeter3.txt sort -t ' ' -c -k20,20 _jeter1.txt #no errors mais il y a une erreur quand je veux les joindeux fichiers …

13 sort join

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Joignez deux fichiers avec des colonnes correspondantes

File1.txt id No gi|371443199|gb|JH556661.1| 7907290 gi|371443198|gb|JH556662.1| 7573913 gi|371443197|gb|JH556663.1| 7384412 gi|371440577|gb|JH559283.1| 6931777 File2.txt id P R S gi|367088741|gb|AGAJ01056324.1| 5 5 0 gi|371443198|gb|JH556662.1| 2 2 0 gi|367090281|gb|AGAJ01054784.1| 4 4 0 gi|371440577|gb|JH559283.1| 21 19 2 output.txt id P R S NO gi|371443198|gb|JH556662.1| 2 2 0 7573913 gi|371440577|gb|JH559283.1| 21 19 2 6931777 File1.txt a …

11 awk join

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Comparez deux fichiers avec la première colonne et supprimez la ligne en double du 2e fichier dans le script shell

Je vais poser ma question avec un exemple. J'ai 2 fichiers: Fichier # 1: 118D FC300_R5_TP FX.B 32775 2112 6 2038 6 2112 0 118E FC300_R5_TP FX.B 32775 2136 7 2065 6 2136 0 118F FC300_R5_TP FX.B 32775 2124 6 2064 6 2124 0 1190 FC300_R5_TP FX.B 819210 814632 99 …

9 shell-script text-processing awk join

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Joindre deux fichiers avec un identifiant unique

J'ai deux fichiers avec environ 12900 et 4400 entrées respectivement, que je veux joindre. Les fichiers contiennent des informations sur l'emplacement de toutes les stations d'observation météorologique terrestres du monde entier. Le plus gros fichier est mis à jour toutes les deux semaines, et le plus petit une fois par …

9 shell-script text-processing awk columns join

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joindre plusieurs lignes sur la base de column1

J'ai un fichier comme ci-dessous .. abc, 12345 def, text and nos ghi, something else jkl, words and numbers abc, 56345 def, text and nos ghi, something else jkl, words and numbers abc, 15475 def, text and nos ghi, something else jkl, words and numbers abc, 123345 def, text and …

8 text-processing command-line awk join merge

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Un script shell pour joindre deux fichiers

Je veux écrire un shell scriptqui obtiennent deux fichiers Aet B, et obtenir un résultat comme celui - ci: Fichier A: user_a tel_a addr_a user_b tel_b addr_b Fichier B: process_1 user_a process_2 user_a process_3 user_b Et le résultat: user_a process_1 tel_a addr_a user_a process_2 tel_a addr_a user_b process_3 tel_b addr_b …

8 text-processing awk join

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