Sachant que le package rgeos, du langage R, nécessite une installation préalable des bibliothèques geos, j'ai installé, à la fois, libgeos et libgeos-c1 (3.2.2), en utilisant le programme d'installation synaptique de ma machine Ubuntu 12.04 (32 bits).
Ensuite, j'ai essayé d'installer rgeos directement à partir de la console R, et il a émis un message dans le sens où geos-config n'a pas été trouvé. La sortie est la suivante:
> install.packages("rgeos")
Installing package(s) into ‘/home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15’
(as ‘lib’ is unspecified)
also installing the dependency ‘sp’
probando la URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/sp_1.0-9.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 882102 bytes (861 Kb)
URL abierta
==================================================
downloaded 861 Kb
probando la URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/rgeos_0.2-19.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 221471 bytes (216 Kb)
URL abierta
==================================================
downloaded 216 Kb
* installing *source* package ‘sp’ ...
** package ‘sp’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -O3 -pipe -g -c R centroid.c -o Rcentroid.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -O3 -pipe -g -c gcdist.c -o gcdist.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -O3 -pipe -g -c init.c -o init.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -O3 -pipe -g -c pip.c -o pip.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -O3 -pipe -g -c pip2.c -o pip2.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -O3 -pipe -g -c sp_xports.c -o sp_xports.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -O3 -pipe -g -c surfaceArea.c -o surfaceArea.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -O3 -pipe -g -c zerodist.c -o zerodist.o
gcc -std=gnu99 -shared -o sp.so Rcentroid.o gcdist.o init.o pip.o pip2.o sp_xports.o surfaceArea.o zerodist.o -L/usr/lib/R/lib -lR
installing to /home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15/sp/libs
** R
** data
** demo
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
‘intro_sp.Rnw’
‘over.Rnw’
** testing if installed package can be loaded
* DONE (sp)
* installing *source* package ‘rgeos’ ...
** package ‘rgeos’ successfully unpacked and MD5 sums checked
configure: CC: gcc -std=gnu99
configure: CXX: g++
configure: rgeos: 0.2-17
checking for /usr/bin/svnversion... no
configure: svn revision: 394
checking geos-config usability...
./configure: line 1385: geos-config: command not found
no
configure: error: geos-config not usable
ERROR: configuration failed for package ‘rgeos’
* removing ‘/home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15/rgeos’
Warning in install.packages :
installation of package ‘rgeos’ had non-zero exit status
Pardonnez mon ignorance, mais je ne sais pas d'où vient ce fichier, "geos-config": doit-il être généré par les compilations gcc ci-dessus, ou doit-il être installé précédemment lorsque les bibliothèques libgeos ont été installées?
J'ai appris, depuis une autre machine, que "geos-config" est un exécutable et qu'il devrait être installé dans / usr / bin.
Avez-vous une idée de ce qui ne va pas avec ma procédure?
Merci,
-Sergio.
apt-filepour rechercher des fichiers dans le référentiel ubuntu. Par exemple.apt-file search geos-configvous donnera une correspondance exactelibgeos-dev.