L'utilisation de la mémoire ne s'accumule pas au fil du temps

L'utilisation de la mémoire sur mon système Ubuntu 13.04 ne s'additionne pas au fil du temps. J'ai essayé les noyaux 3.8.0-xx et le dernier 3.9 de / ~ kernel-ppa / mainline.

Au premier démarrage, tout s'additionne correctement, mais après quelques jours, voici à quoi cela ressemble.

$ free -k
             total       used       free     shared    buffers     cached
Mem:       7978976    7319920     659056          0      97248    1344356
-/+ buffers/cache:    5878316    2100660
Swap:      2438140          0    2438140

Free rapporte qu'environ 5,8 G de mémoire résidente sont utilisés, à l'exception du cache et des tampons.

Lorsque je résume le rss rapporté par la commande ps, les totaux diffèrent considérablement.

sudo ps -eo pid,rss,args  > mem.txt

  PID      RSS  COMMAND
6377    848,268  /usr/lib/firefox/firefox
6095    243,664  /usr/bin/gnome-shell
1752    72,300  /usr/sbin/mysqld
6167    71,460  /var/lib/dropbox/.dropbox-dist/dropbox
7608    66,952  /usr/bin/python /usr/bin/deluge-gtk
23320   57,892  /usr/bin/X :3 -background none -verbose -auth /run/gdm/auth-for-gdm-9zmczs/database -nolisten tcp vt7
6445    45,476  /usr/lib/firefox/plugin-container /usr/lib/adobe-flashplugin/libflashplayer.so -greomni /usr/lib/firefox/omni.ja -appomni /usr/lib/firefox/browser/omni.ja -appdir /usr/lib/firefox/browser 6377 true plugin
6159    39,784  nautilus -n
6153    37,276  /usr/bin/python /usr/bin/autokey-gtk
9306    29,432  gnome-terminal
6152    27,152  nm-applet
6066    24,796  /usr/lib/gnome-settings-daemon/gnome-settings-daemon
6434    20,120  /usr/lib/firefox/plugin-container /opt/google/talkplugin/libnpgoogletalk.so -greomni /usr/lib/firefox/omni.ja -appomni /usr/lib/firefox/browser/omni.ja -appdir /usr/lib/firefox/browser 6377 true plugin
9505    17,700  /usr/sbin/apache2 -k start
6154    16,096  update-notifier
6437    13,516  /opt/google/talkplugin/GoogleTalkPlugin
6184    13,192  /usr/lib/evolution/evolution-calendar-factory
5983    12,372  gnome-session --session=gnome
3746    9,468   /usr/bin/python /usr/bin/fail2ban-server -b -s /var/run/fail2ban/fail2ban.sock
9510    8,476   /usr/sbin/apache2 -k start
9511    8,476   /usr/sbin/apache2 -k start
9512    8,476   /usr/sbin/apache2 -k start
9513    8,476   /usr/sbin/apache2 -k start
9514    8,476   /usr/sbin/apache2 -k start
6112    7,732   /usr/lib/evolution/evolution-source-registry
1890    7,212   /usr/bin/atop -a -w /var/log/atop/atop_20130425 600
6106    6,912   /usr/lib/gnome-shell/gnome-shell-calendar-server
1646    6,868   NetworkManager
6073    6,404   /usr/bin/pulseaudio --start --log-target=syslog
6125    6,080   /usr/lib/telepathy/mission-control-5
5588    5,592   /usr/lib/udisks2/udisksd --no-debug
1229    5,568   /usr/lib/colord/colord
6129    5,560   /usr/lib/gvfs/gvfs-udisks2-volume-monitor
1205    5,532   smbd -F
5954    5,220   gdm-session-worker [pam/gdm-password]
1656    5,164   /usr/lib/policykit-1/polkitd --no-debug
9312    5,112   -bash
5965    5,040   /usr/bin/gnome-keyring-daemon --daemonize --login
9531    4,952   -bash
1759    4,900   whoopsie
1606    4,412   /usr/sbin/winbindd -F
3149    4,300   /usr/lib/upower/upowerd
2992    4,068   /usr/sbin/console-kit-daemon --no-daemon
23316   3,952   /usr/lib/gdm/gdm-simple-slave --display-id /org/gnome/DisplayManager/Displays/_3
6299    3,800   /usr/lib/gvfs/gvfsd-metadata
1090    3,748   /usr/sbin/cupsd -F
1721    3,708   /sbin/dhclient -d -sf /usr/lib/NetworkManager/nm-dhcp-client.action -pf /run/sendsigs.omit.d/network-manager.dhclient-eth0.pid -lf /var/lib/NetworkManager/dhclient-681b428f-beaf-8932-dce4-687ed5bae28e-eth0.lease -cf /var/lib/NetworkManager/dhclient-eth0.conf eth0
2988    3,672   /usr/lib/accountsservice/accounts-daemon
6228    3,540   /usr/lib/gvfs/gvfsd-trash --spawner :1.4 /org/gtk/gvfs/exec_spaw/0
6043    3,296   /usr/lib/at-spi2-core/at-spi2-registryd --use-gnome-session
1728    3,288   gdm
6136    3,220   /usr/lib/gvfs/gvfs-gphoto2-volume-monitor
6144    3,212   /usr/lib/gvfs/gvfs-afc-volume-monitor
6036    3,204   /usr/lib/at-spi2-core/at-spi-bus-launcher
1607    3,196   /usr/sbin/modem-manager
1   3,096   /sbin/init
6087    3,044   /usr/lib/pulseaudio/pulse/gconf-helper
6047    2,992   /usr/lib/gvfs/gvfsd
6089    2,900   /usr/lib/x86_64-linux-gnu/gconf/gconfd-2
6274    2,832   /usr/lib/dconf/dconf-service
1248    2,772   /usr/sbin/cups-browsed
1571    2,696   /usr/sbin/sshd -D
6140    2,648   /usr/lib/gvfs/gvfs-mtp-volume-monitor
1484    2,608   dhclient -1 -v -pf /run/dhclient.eth0.pid -lf /var/lib/dhcp/dhclient.eth0.leases eth0
9662    2,600   sudo ps -eo pid,rss,args
3614    2,428   /usr/sbin/afpd -U uams_dhx2.so,uams_clrtxt.so -g nobody -c 50 -n cheetah
771 2,340   dbus-daemon --system --fork
5376    2,124   /usr/sbin/ntpd -p /var/run/ntpd.pid -g -u 117:126
6032    1,908   //bin/dbus-daemon --fork --print-pid 5 --print-address 7 --session
1642    1,780   /usr/sbin/winbindd -F
3460    1,760   qmgr -l -t fifo -u
928 1,728   avahi-daemon: running [cheetah.local]
866 1,704   /usr/sbin/bluetoothd
719 1,700   /sbin/udevd --daemon
9637    1,696   man ps
1627    1,684   nmbd -D
762 1,652   rsyslogd -c5
2850    1,636   /usr/lib/postfix/master
1239    1,608   smbd -F
7599    1,608   pickup -l -t fifo -u -c
6040    1,488   /bin/dbus-daemon --config-file=/etc/at-spi2/accessibility.conf --nofork --print-address 3
1760    1,472   /usr/sbin/dnsmasq --no-resolv --keep-in-foreground --no-hosts --bind-interfaces --pid-file=/var/run/NetworkManager/dnsmasq.pid --listen-address=127.0.1.1 --conf-file=/var/run/NetworkManager/dnsmasq.conf --cache-size=0 --proxy-dnssec --enable-dbus=org.freedesktop.NetworkManager.dnsmasq --conf-dir=/etc/NetworkManager/dnsmasq.d
5399    1,368   /sbin/udevd --daemon
5400    1,368   /sbin/udevd --daemon
1233    1,356   rpc.statd -L
3516    1,308   /usr/lib/rtkit/rtkit-daemon
9648    1,188   pager -s
1719    1,044   cron
1675    976 /sbin/getty -8 38400 tty5
1691    976 /sbin/getty -8 38400 tty2
1692    972 /sbin/getty -8 38400 tty3
1695    972 /sbin/getty -8 38400 tty6
3971    972 /sbin/getty -8 38400 tty1
1668    968 /sbin/getty -8 38400 tty4
1216    964 rpcbind -w
716 900 upstart-udev-bridge --daemon
2893    880 /usr/sbin/dnsmasq -x /var/run/dnsmasq/dnsmasq.pid -u dnsmasq -r /var/run/dnsmasq/resolv.conf -7 /etc/dnsmasq.d,.dpkg-dist,.dpkg-old,.dpkg-new
9663    868 ps -eo pid,rss,args
9311    824 gnome-pty-helper
1703    816 acpid -c /etc/acpi/events -s /var/run/acpid.socket
1737    776 /usr/sbin/irqbalance
3606    760 /usr/sbin/cnid_metad -l log_note
1235    732 upstart-socket-bridge --daemon
763 680 rpc.idmapd
6031    592 /usr/bin/dbus-launch --exit-with-session gnome-session --session=gnome
933 472 avahi-daemon: chroot helper
457 420 upstart-file-bridge --daemon
6028    316 /usr/bin/ssh-agent /usr/bin/dbus-launch --exit-with-session gnome-session --session=gnome
1717    168 atd
2   0   [kthreadd]
3   0   [ksoftirqd/0]
5   0   [kworker/0:0H]
7   0   [kworker/u:0H]
8   0   [migration/0]
9   0   [rcu_bh]
10  0   [rcu_sched]
11  0   [watchdog/0]
12  0   [watchdog/1]
13  0   [migration/1]
14  0   [ksoftirqd/1]
16  0   [kworker/1:0H]
17  0   [watchdog/2]
18  0   [migration/2]
19  0   [ksoftirqd/2]
21  0   [kworker/2:0H]
22  0   [watchdog/3]
23  0   [migration/3]
24  0   [ksoftirqd/3]
26  0   [kworker/3:0H]
27  0   [watchdog/4]
28  0   [migration/4]
29  0   [ksoftirqd/4]
31  0   [kworker/4:0H]
32  0   [watchdog/5]
33  0   [migration/5]
34  0   [ksoftirqd/5]
36  0   [kworker/5:0H]
37  0   [khelper]
38  0   [kdevtmpfs]
39  0   [netns]
40  0   [bdi-default]
41  0   [kintegrityd]
42  0   [kblockd]
43  0   [ata_sff]
44  0   [khubd]
45  0   [md]
46  0   [devfreq_wq]
48  0   [irq/72-AMD-Vi]
49  0   [khungtaskd]
50  0   [kswapd0]
51  0   [ksmd]
52  0   [khugepaged]
53  0   [fsnotify_mark]
54  0   [ecryptfs-kthrea]
55  0   [crypto]
66  0   [kthrotld]
74  0   [binder]
93  0   [deferwq]
94  0   [charger_manager]
198 0   [scsi_eh_0]
204 0   [scsi_eh_1]
205 0   [firewire]
219 0   [kworker/u:3]
220 0   [scsi_eh_2]
239 0   [scsi_eh_3]
251 0   [scsi_eh_4]
255 0   [scsi_eh_5]
259 0   [scsi_eh_6]
260 0   [scsi_eh_7]
269 0   [kworker/u:6]
283 0   [scsi_eh_8]
284 0   [scsi_eh_9]
360 0   [kworker/5:1H]
361 0   [jbd2/sda1-8]
362 0   [ext4-dio-unwrit]
643 0   [xfsalloc]
644 0   [xfs_mru_cache]
645 0   [xfslogd]
646 0   [xfs-data/sdb1]
647 0   [xfs-conv/sdb1]
648 0   [xfs-cil/sdb1]
650 0   [xfsaild/sdb1]
695 0   [xfs-data/sdc1]
696 0   [xfs-conv/sdc1]
697 0   [xfs-cil/sdc1]
698 0   [xfsaild/sdc1]
730 0   [rpciod]
743 0   [nfsiod]
922 0   [krfcommd]
944 0   [kworker/4:1H]
1017    0   [edac-poller]
1029    0   [hd-audio0]
1031    0   [kpsmoused]
1060    0   [kvm-irqfd-clean]
1107    0   [hd-audio1]
1157    0   [kworker/3:1H]
1190    0   [kworker/2:1H]
1198    0   [kworker/1:1H]
1793    0   [kauditd]
1845    0   [flush-8:0]
3569    0   [iprt]
4867    0   [kworker/4:1]
5403    0   [nfsv4.0-svc]
5848    0   [kworker/0:1H]
5935    0   [kworker/2:3]
9274    0   [kworker/5:2]
9527    0   [kworker/5:0]
9630    0   [flush-8:32]
10694   0   [kworker/3:3]
13358   0   [kworker/1:0]
18154   0   [kworker/0:0]
19625   0   [kworker/4:0]
23502   0   [kworker/3:2]
31403   0   [kworker/2:1]
32141   0   [kworker/0:2]
32655   0   [kworker/1:1]
    1,939,900   

ps rapporte que la somme de toute la mémoire résidente utilisée par tous mes processus est d'environ 1,9G.

Quels processus utilisent les 3,9 G restants?

EDIT : Plus d'informations sur l'utilisation de la mémoire du noyau. slabtop signale ce qui suit.

  OBJS ACTIVE  USE OBJ SIZE  SLABS OBJ/SLAB CACHE SIZE NAME                   
2233988 2233988 100%    0.88K  62057       36   1985824K xfs_inode              
735948 714094  97%    0.22K  20443       36    163544K xfs_ili                
129280 117946  91%    1.00K   4040       32    129280K nfs_inode_cache        
 92344  92344 100%    0.93K   2716       34     86912K ext4_inode_cache       
292866 292866 100%    0.19K  13946       21     55784K dentry                 
 75096  71346  95%    0.55K   2682       28     42912K radix_tree_node     

Est-ce à dire que le noyau utilise près de 2 Go pour mettre en cache xfs_inodes, cache qui n'est pas signalé dans la colonne mise en cache de la commande gratuite?

La mémoire a été trouvée. C'était dans le cache xfs_inode qui n'était pas signalé par ps ou free. slabtopm'a cependant montré ce dont j'avais besoin. La raison d'un si grand cache xfs_inode est due à une sauvegarde nocturne. La mémoire peut être libérée avec la commande suivante.

echo 3 > /proc/sys/vm/drop_caches

Depuis http://www.linuxinsight.com/proc_sys_vm_drop_caches.html

Pour libérer la pagecache:

echo 1 > /proc/sys/vm/drop_caches

Pour libérer des dentiers et des inodes:

echo 2 > /proc/sys/vm/drop_caches

Pour libérer la pagecache, les dentiers et les inodes:

echo 3 > /proc/sys/vm/drop_caches

Plus d'informations peuvent être trouvées sur ce blog.

http://serenadetoacuckooo.blogspot.ca/2012/03/linux-memory-tweaks-for-improved.html

Je dois maintenant décider si je veux supprimer le cache après les sauvegardes, remettre vfs_cache_pressure à 100 ou simplement acheter plus de mémoire.