J'ai un data.frame avec 800 obs. de 40 variables, et j'aimerais utiliser l'analyse des composants principaux pour améliorer les résultats de ma prédiction (qui fonctionne jusqu'à présent le mieux avec Support Vector Machine sur une quinzaine de variables sélectionnées à la main).
Je comprends qu'un prcomp peut m'aider à améliorer mes prévisions, mais je ne sais pas comment utiliser les résultats de la fonction prcomp.
J'obtiens le résultat:
> PCAAnalysis <- prcomp(TrainTrainingData, scale.=TRUE)
> summary(PCAAnalysis)
Importance of components:
PC1 PC2 PC3 PC4 PC5 PC6 PC7 PC8 PC9 PC10 PC11 PC12 PC13 PC14
Standard deviation 1.7231 1.5802 1.3358 1.2542 1.1899 1.166 1.1249 1.1082 1.0888 1.0863 1.0805 1.0679 1.0568 1.0520
Proportion of Variance 0.0742 0.0624 0.0446 0.0393 0.0354 0.034 0.0316 0.0307 0.0296 0.0295 0.0292 0.0285 0.0279 0.0277
Cumulative Proportion 0.0742 0.1367 0.1813 0.2206 0.2560 0.290 0.3216 0.3523 0.3820 0.4115 0.4407 0.4692 0.4971 0.5248
PC15 PC16 PC17 PC18 PC19 PC20 PC21 PC22 PC23 PC24 PC25 PC26 PC27 PC28
Standard deviation 1.0419 1.0283 1.0170 1.0071 1.001 0.9923 0.9819 0.9691 0.9635 0.9451 0.9427 0.9238 0.9111 0.9073
Proportion of Variance 0.0271 0.0264 0.0259 0.0254 0.025 0.0246 0.0241 0.0235 0.0232 0.0223 0.0222 0.0213 0.0208 0.0206
Cumulative Proportion 0.5519 0.5783 0.6042 0.6296 0.655 0.6792 0.7033 0.7268 0.7500 0.7723 0.7945 0.8159 0.8366 0.8572
PC29 PC30 PC31 PC32 PC33 PC34 PC35 PC36 PC37 PC38
Standard deviation 0.8961 0.8825 0.8759 0.8617 0.8325 0.7643 0.7238 0.6704 0.60846 0.000000000000000765
Proportion of Variance 0.0201 0.0195 0.0192 0.0186 0.0173 0.0146 0.0131 0.0112 0.00926 0.000000000000000000
Cumulative Proportion 0.8773 0.8967 0.9159 0.9345 0.9518 0.9664 0.9795 0.9907 1.00000 1.000000000000000000
PC39 PC40
Standard deviation 0.000000000000000223 0.000000000000000223
Proportion of Variance 0.000000000000000000 0.000000000000000000
Cumulative Proportion 1.000000000000000000 1.000000000000000000
Je pensais que j'obtiendrais les paramètres les plus importants à utiliser, mais je ne trouve tout simplement pas ces informations. Tout ce que je vois, c'est l'écart type, etc. sur les PC. Mais comment utiliser cela pour la prédiction?
pls
(Partial Least Squares), qui a des outils pour la PCR ( Principal Component Regression ).