Estimation d'une probabilité de survie dans R


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Sur la base d'un échantillon de temps de survie, je voudrais estimer la probabilité de survivre au temps , pour certains spécifiques , à l'aide de l'estimateur de Kaplan-Meier. Est-il possible de le faire en ? S'il vous plaît, notez que est pas nécessairement un temps d'événement.nttRt


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Bien sûr: voir la fonction survfit () du package de survie [type help (package = "survival")]
Stéphane Laurent

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@Stephane Laurent: La fonction surfit () génère la survie estimée aux moments des événements. Mais j'aimerais avoir une procédure automatique pour calculer cette survie à tout moment t. Merci ...
user7064

Ensuite, utilisez approxfun ()
Stéphane Laurent

puis-je avoir un exemple?
user7064

Réponses:


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Vous pouvez utiliser la sortie de la survfitfonction du survivalpackage et la donner à stepfun.

km <- survfit(Surv(time, status)~1, data=veteran)
survest <- stepfun(km$time, c(1, km$surv))

Maintenant, survestc'est une fonction qui peut être évaluée à tout moment.

> survest(0:100)
  [1] 1.0000000 0.9854015 0.9781022 0.9708029 0.9635036 0.9635036 0.9635036
  [8] 0.9416058 0.9124088 0.9124088 0.8978102 0.8905109 0.8759124 0.8613139
 [15] 0.8613139 0.8467153 0.8394161 0.8394161 0.8175182 0.8029197 0.7883212
 [22] 0.7737226 0.7664234 0.7664234 0.7518248 0.7299270 0.7299270 0.7225540
 [29] 0.7225540 0.7151810 0.7004350 0.6856890 0.6856890 0.6783160 0.6783160
 [36] 0.6709430 0.6635700 0.6635700 0.6635700 0.6635700 0.6635700 0.6635700
 [43] 0.6561970 0.6488240 0.6414510 0.6340780 0.6340780 0.6340780 0.6267050
 [50] 0.6193320 0.6193320 0.5972130 0.5750940 0.5677210 0.5529750 0.5529750
 [57] 0.5456020 0.5456020 0.5456020 0.5382290 0.5382290 0.5308560 0.5308560
 [64] 0.5234830 0.5234830 0.5234830 0.5234830 0.5234830 0.5234830 0.5234830
 [71] 0.5234830 0.5234830 0.5161100 0.5087370 0.5087370 0.5087370 0.5087370
 [78] 0.5087370 0.5087370 0.5087370 0.4939910 0.4939910 0.4866180 0.4866180
 [85] 0.4791316 0.4791316 0.4791316 0.4716451 0.4716451 0.4716451 0.4640380
 [92] 0.4640380 0.4564308 0.4564308 0.4564308 0.4412164 0.4412164 0.4412164
 [99] 0.4412164 0.4257351 0.4179945

Surreal a un problème, cherche une réponse sur StackExchange, trouve la même question et se rend compte que c'est vous qui y avez répondu il y a presque 7 ans ...
Brian Diggs

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Un paramètre de temps peut être passé à la fonction récapitulative de l'objet survfit:

summary(km, times=100)

Un vecteur peut également être transmis:

summary(km, times=0:100)
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