On m'a demandé d'utiliser des tests t d'échantillons appariés protégés dans une analyse. Le demandeur déclare que si je n'utilise pas la MSe globale de mon (1 facteur avec quatre niveaux) ANOVA intra-sujets lors de mes tests t d'échantillons appariés, il n'y a pas vraiment de protection contre l'ANOVA.
Si je me souviens bien, dans une ANOVA entre sujets, cette procédure n'est défendable que si l'hypothèse d'homogénéité de la variance est remplie. Il semble qu'une extension probable à l'ANOVA intra-sujet pourrait être que cela n'est permis que s'il n'y a pas de violation de la sphéricité. Parce qu'il y a des violations dans cet ensemble de données, j'ai choisi d'appliquer la correction de Huynh-Feldt pour la sphéricité. Quoi qu'il en soit, une telle approche semble anti-conservatrice car elle offre plus de degrés de liberté au dénominateur. De plus, le fichier d'aide dans R pour pairwise.t.test indique que «le regroupement ne se généralise pas aux tests appariés».
Le but de mes tests t de comparaison prévus est simplement d'identifier les différences entre les conditions qui ont abouti à une ANOVA significative. J'aimerais pouvoir justifier mes raisons de rejeter la mise en commun des écarts d'erreur, mais je ne trouve pas de citation qui indique clairement qu'une telle approche est inappropriée. Quelqu'un en connaît-il un? Sinon, pourquoi ma réflexion sur ce problème est-elle incorrecte?