En fait, l'objectif influence la mise au point de deux manières:
1) La vitesse avec laquelle il se concentre (vitesse de son moteur)
2) La quantité de lumière qu'il recueille (liée à l'arrêt f)
De toute évidence, plus le moteur de mise au point est rapide et plus l'objectif recueille de lumière, plus il se concentre rapidement. Mais la confirmation et la recherche de la mise au point dépendent également de l'appareil photo que vous utilisez, ce qui peut entraîner des incohérences entre les différentes combinaisons appareil photo + objectif.
Vous pouvez installer un objectif nikkor 24-70 f2.8 (sacrément rapide) sur un D40 qui a environ 3 points de mise au point automatique et un système de mise au point relativement simple, et il se concentrera toujours assez rapidement; CEPENDANT, il ne sera probablement pas correctement mis au point à chaque fois, en raison de la nature simpliste du système de mise au point automatique de l'appareil photo.
Si vous collez le même objectif sur un D300s ou supérieur, qui a probablement plus de 50 points de mise au point automatique et un processeur / système bien meilleur pour les utiliser tous, vous obtiendrez beaucoup moins mal focalisés.
Répondre à votre question: les objectifs AF (Nikon) sont des objectifs sans moteur autofocus, ils se concentrent en tournant une vis sur la monture d'objectif - l'appareil photo fait tout cela, et seuls les modèles semi-professionnels ou supérieurs le font (d90 ou mieux). Les objectifs AF-S ont un moteur intégré, ils se focalisent automatiquement sur tous les appareils photo modernes, même les moins chers.
Je ne connais pas les différences précises entre les performances de ces deux types d'objectifs, mais comme les objectifs plus récents et plus chers ont tous des moteurs AF-S dédiés, je suppose qu'un moteur de mise au point dédié améliore les performances.