J'essaie de lire un fichier raster au format .DEM sur Windows en utilisant le package «raster» dans R.
J'ai des problèmes avec les valeurs NA, lors du chargement des données dans R dans Windows 7, mais je n'ai pas le problème sur un Mac avec OSX Lion. Sous Windows, les valeurs NA ne semblent pas être lues correctement. La question est pourquoi cela se produit-il?
Le fichier raster utilisé a été téléchargé depuis USGS avec le code R suivant:
download.file('http://edcftp.cr.usgs.gov/pub/data/gtopo30/global/e020n90.tar.gz', 'e020n90.tar.gz')
untar('e020n90.tar.gz')
Ensuite, j'ai lu le raster dans R en utilisant le package «raster». Dans OSX Lion et R64 version 2.13.1, les valeurs NA sont reconnues:
> onMac <- raster('E020N90.DEM')
> onMac
class : RasterLayer
dimensions : 6000, 4800, 28800000 (nrow, ncol, ncell)
resolution : 0.008333333, 0.008333333 (x, y)
extent : 20, 60, 40, 90 (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=longlat +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0,0,0,0,0 +no_defs
values : /Users/Tam/Desktop/E020N90.DEM
min value : -9999
max value : 5483
> summary(values(onMac))
Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max. NA's
-137 85 148 213 213 5483 13046160
Mais sur Windows 7 (64Bit, même version R), il convertit les valeurs de cellule qui devraient être NA en nombres:
> onWindows <- raster('E020N90.DEM')
> onWindows
class : RasterLayer
dimensions : 6000, 4800, 28800000 (nrow, ncol, ncell)
resolution : 0.008333333, 0.008333333 (x, y)
extent : 20, 60, 40, 90 (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=longlat +ellps=WGS84 +datum=WGS84 +no_defs +towgs84=0,0,0
values : E:/WorldDegreeDays/gsoddata/gtopo/E020N90.DEM
min value : -9999
max value : 5483
> summary(values(onWindows))
Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max.
1 150 946 27190 55540 65540
Pourquoi n'y a-t-il pas de valeurs NA dans le raster lorsque je le lis sur Windows? Comment pourrais-je contourner ce problème? Je suppose que cela a à voir avec la façon dont les nombres sont stockés, une grande partie des valeurs NA sont converties en 55540.
Informations de Windows (après le chargement du raster):
SessionInfo()
R version 2.13.1 (2011-07-08)
Platform: x86_64-pc-mingw32/x64 (64-bit)
locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252
[2] LC_CTYPE=English_United States.1252
[3] LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C
[5] LC_TIME=English_United States.1252
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] rgdal_0.7-1 raster_1.9-12 sp_0.9-88
loaded via a namespace (and not attached):
[1] grid_2.13.1 lattice_0.19-30
Informations d'OSX (après le chargement du raster):
R version 2.13.1 (2011-07-08)
Platform: x86_64-apple-darwin9.8.0/x86_64 (64-bit)
locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods
[7] base
other attached packages:
[1] rgdal_0.6-33 raster_1.9-12 sp_0.9-88
loaded via a namespace (and not attached):
[1] grid_2.13.1 lattice_0.19-33
sessionInfo()
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