J'utilise un serveur MySQL pour des tests sur une machine virtuelle (VMWare) avec Debian comme OS invité. L'invité a quatre cœurs CPU émulés, j'ai donc défini thread_concurrency sur quatre.
Je fais des jointures coûteuses sur de grandes tables, ce qui peut prendre plusieurs minutes, mais je vois sur le système d'exploitation invité, qu'un seul cœur est utilisé à la fois. Cela se produit quel que soit le moteur de stockage utilisé pour les tables impliquées (testé avec MyISAM et InnoDB). De plus, toute la base de données semble être bloquée lors de ces grandes requêtes, je ne peux pas faire de requêtes supplémentaires en parallèle. Étrangement htop montre que le noyau utilisé pour la requête change pendant l'exécution de la requête!
Pourquoi cela arrive-t-il?
Il s'agit de l'entrée pertinente de SHOW FULL PROCESSLIST;(il n'y a pas d'autres requêtes):
| 153 | root | localhost | pulse_stocks | Query | 50 | Copying to tmp table |
SELECT DISTINCT * FROM
`pulse_stocks`.`stocks` sto,
`pulse_new`.`security` sec
WHERE
(sto.excntry = sec.excntry AND sto.stock_id = sec.ibtic) OR
( sto.isin = sec.isin AND sto.isin <> "" AND sec.isin <> "" )
ORDER BY
sto.id
LIMIT 0, 30
Aucune autre requête n'est en attente. Une autre observation intéressante est que MySQL répondra à cette requête dans une seconde, si je laisse de côté la ORDER BYpartie.
C'est ce que SHOW ENGINE INNODB STATUS;montre:
=====================================
120316 9:55:56 INNODB MONITOR OUTPUT
=====================================
Per second averages calculated from the last 49 seconds
----------
SEMAPHORES
----------
OS WAIT ARRAY INFO: reservation count 47258, signal count 47258
Mutex spin waits 0, rounds 10260, OS waits 39
RW-shared spins 94442, OS waits 47210; RW-excl spins 1, OS waits 1
------------
TRANSACTIONS
------------
Trx id counter 0 5381
Purge done for trx's n:o < 0 1810 undo n:o < 0 0
History list length 2
LIST OF TRANSACTIONS FOR EACH SESSION:
---TRANSACTION 0 0, not started, process no 7503, OS thread id 140316748777216
MySQL thread id 154, query id 654 localhost root
SHOW ENGINE INNODB STATUS
---TRANSACTION 0 5380, ACTIVE 105 sec, process no 7503, OS thread id 140316748977920
fetching rows, thread declared inside InnoDB 429
mysql tables in use 2, locked 0
MySQL thread id 153, query id 623 localhost root Copying to tmp table
SELECT DISTINCT * FROM
`pulse_stocks`.`stocks` sto,
`pulse_new`.`security` sec
WHERE
(sto.excntry = sec.excntry AND sto.stock_id = sec.ibtic) OR
( sto.isin = sec.isin AND sto.isin <> "" AND sec.isin <> "" )
ORDER BY
sto.id
LIMIT 0, 30
Trx read view will not see trx with id >= 0 5381, sees < 0 5381
--------
FILE I/O
--------
I/O thread 0 state: waiting for i/o request (insert buffer thread)
I/O thread 1 state: waiting for i/o request (log thread)
I/O thread 2 state: waiting for i/o request (read thread)
I/O thread 3 state: waiting for i/o request (write thread)
Pending normal aio reads: 0, aio writes: 0,
ibuf aio reads: 0, log i/o's: 0, sync i/o's: 0
Pending flushes (fsync) log: 0; buffer pool: 0
116089 OS file reads, 7 OS file writes, 7 OS fsyncs
1063.16 reads/s, 117085 avg bytes/read, 0.00 writes/s, 0.00 fsyncs/s
-------------------------------------
INSERT BUFFER AND ADAPTIVE HASH INDEX
-------------------------------------
Ibuf: size 1, free list len 5, seg size 7,
0 inserts, 0 merged recs, 0 merges
Hash table size 17393, node heap has 1 buffer(s)
0.00 hash searches/s, 14.73 non-hash searches/s
---
LOG
---
Log sequence number 0 38201270
Log flushed up to 0 38201270
Last checkpoint at 0 38201270
0 pending log writes, 0 pending chkp writes
10 log i/o's done, 0.00 log i/o's/second
----------------------
BUFFER POOL AND MEMORY
----------------------
Total memory allocated 20638760; in additional pool allocated 994816
Dictionary memory allocated 162680
Buffer pool size 512
Free buffers 0
Database pages 511
Modified db pages 0
Pending reads 0
Pending writes: LRU 0, flush list 0, single page 0
Pages read 816631, created 0, written 1
7597.72 reads/s, 0.00 creates/s, 0.00 writes/s
Buffer pool hit rate 964 / 1000
--------------
ROW OPERATIONS
--------------
1 queries inside InnoDB, 0 queries in queue
2 read views open inside InnoDB
Main thread process no. 7503, id 140316711446272, state: waiting for server activity
Number of rows inserted 0, updated 0, deleted 0, read 160338394
0.00 inserts/s, 0.00 updates/s, 0.00 deletes/s, 1495933.31 reads/s
----------------------------
END OF INNODB MONITOR OUTPUT
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Veuillez publier la sortie de SHOW FULL PROCESSLIST (éventuellement nettoyé) et SHOW ENGINE INNODB STATUS pour nous aider à diagnostiquer pourquoi "toute la base de données" est verrouillée.
—
Aaron Brown
Merci, j'ai mis à jour la question avec les informations demandées.
—
Thomas
S'il n'y a aucune autre requête en cours d'exécution, il n'y a aucune preuve que la base de données entière est verrouillée. Pouvez-vous reproduire cette condition et publier ce qui se passe lorsque la requête de longue durée bloque apparemment les autres?
—
Baron Schwartz
Ok, j'ai vérifié ça. Il est possible de faire d'autres requêtes dans la console mysql, même lorsque la grande requête est en cours d'exécution. Cependant, phpmyadmin ne répond pas du tout, même aux simples tentatives de connexion, pendant l'exécution de la requête. Le temps d'exécution lui-même est souvent inférieur à 10 secondes, mais la requête reste dans l'état "envoi de données" pendant plusieurs minutes.
—
Thomas