Organisation des données de recherche

C'est une question dans l'esprit de celle-ci où j'ai répondu qu'il est important de garder une trace de ce que vous avez fait quelque chose, pourquoi vous l'avez fait et ce qui ne fonctionne pas. J'utilise personnellement des ordinateurs portables à cette fin, mais cela présente plusieurs inconvénients: d'abord, j'ai besoin de beaucoup de surface de stockage, deuxièmement lorsque je voyage, je ne peux pas accéder à mes données, et finalement ce n'est pas collaboratif. Il a cependant un gros plus: le cahier peut être utilisé comme l'équivalent d'un cahier de laboratoire (il suffit de trouver quelqu'un pour signer chaque page ...).

Je souhaite donc savoir comment les autres chercheurs procèdent en la matière. Par exemple, existe-t-il un logiciel spécifique qui résout tous les problèmes que j'ai mentionnés?

Plusieurs logiciels peuvent être utilisés pour la cartographie mentale . Voici une liste .

Je suggère également des logiciels comme Microsoft OneNote ou d'autres logiciels de prise de notes .

Si vous avez une tablette PC ou une tablette graphique, je suggère d'utiliser Windows Journal ou d'autres alternatives (comme Xournal ).

Modifier: pour les cahiers de laboratoire , veuillez vous référer à Cahier de laboratoire électronique et Open Notebook Science .

Pour les utilisateurs d'emacs, il existe un mode org extrêmement utile . C'est un mode emacs qui, en simple ascii, vous aide à organiser votre vie ou au moins vos recherches :) Il a des TODO, des délais, des calendriers, des efforts, des tableaux avec certaines capacités de calcul et beaucoup d'autres fonctionnalités. Il peut exporter des projets en LaTeX, html ou autres formats. Comme il est basé sur du texte, vous pouvez gérer des projets simultanément en utilisant un système de versions simultanées distribuées , comme git ou mercurial ...

J'avais l'habitude (et dans une petite mesure, je le fais toujours) d'avoir tout éparpillé sur des cahiers et des classeurs, mais récemment, j'en ai eu marre et je suis passé à un wiki personnel TiddlyWiki . Il peut être hébergé entièrement localement (il s'agit d'un seul fichier html), s'exécute dans votre navigateur et, après l'installation d'un simple plug-in, il prend en charge les mathématiques de type LaTeX. Je l'utilise pour prendre des notes sur des articles que je lis ainsi que pour noter des idées et des explications de moi-même sur des choses qui me déroutent.

J'utilise le contrôle des révisions à cet effet. En reculant dans le temps, on peut voir l'état du programme à un moment donné, couplé au journal des modifications qui (espérons-le) indique pourquoi il en est ainsi. Mettre les données et les documents ainsi que le code dans le contrôle des révisions rend tout fonctionne encore mieux.

J'utilisais des fichiers LaTeX plus SVN pour garder une trace de mes notes.

Mais récemment, j'ai déclaré utiliser SVN avec un Wiki TiddlyWiki personnel (qu'Artem Kaznatcheev a mentionné ci-dessus) avec un plug-in pour jsMath afin que je puisse utiliser LaTeX dans mes notes. Il est assez facile à configurer et à utiliser (il s'agit d'un seul fichier html). TiddlyWiki a des fonctionnalités de marquage et de recherche.

Taper dans LaTeX habituel permet de copier ces notes directement sans modification dans un fichier LaTeX. Il existe également de nombreux autres plug-ins que vous pouvez trouver sur Google, par exemple ce TiddlyVault .

La chose vraiment agréable est que vous pouvez avoir une copie de vos notes sur votre ordinateur portable (afin que vous puissiez travailler avec eux hors ligne), et une autre sur votre page Web (afin que vous puissiez travailler avec eux en ligne de n'importe où) et les conserver en synchronisation à l'aide de SVN. Vous pouvez également l'utiliser de manière collaborative.

L'idée m'est venue en lisant ceci .

Plug-in Zotero Firefox

Je pense que vous aimerez knowen.org . Je l'utilise depuis un certain temps maintenant pour à la fois prendre des notes et collaborer avec les autres. Knowen permet de stocker des notes (nœuds) avec toutes les pièces jointes pertinentes dans un DAG, conserve l'historique de toutes les versions précédentes, dispose d'outils de collaboration assez pratiques. Le langage des nœuds est un simple markdown + MathJax, qui peut être exporté et converti en LaTeX standard avec pandoc. Il est simple à utiliser, mais puissant.