tmux oblige anaconda à utiliser une source python différente

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Ok, donc je suis dans mon environnement anaconda et j'ai couru quel python. Je reçois

/home/comp/anaconda3/envs/env1/bin/python

Maintenant, si je démarre tmux, puis exécute source activate env1, puis quel python, j'obtiens

/home/comp/anaconda3/bin/python

même si mon environnement est activé. Comment puis-je faire anaconda voir le même chemin à l'intérieur de tmux?

python tmux

— leniX
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La solution semble être de désactiver l'environnement conda, puis de démarrer tmux, puis de réactiver l'environnement à l'intérieur de tmux.

— leniX
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Une solution bizarre mais qui fonctionne ...

— LYu

C'est vraiment bizarre.

— ZirconCode

2

Je vote positivement parce que c'est la solution qui a fonctionné pour moi, mais c'est vraiment loin d'être la solution idéale

— johnchase

2

Ce qui m'arrive après avoir commencé une session Tmux (sans conda ayant un env actif).

Quand je fais pour la première fois à l'intérieur de la session Tmux:

conda activate myEnv

Je reçois

CommandNotFoundError: Your shell has not been properly configured to use 'conda activate'.
To initialize your shell, run

    $ conda init <SHELL_NAME>

Currently supported shells are:
  - bash
  - fish
  - tcsh
  - xonsh
  - zsh
  - powershell

See 'conda init --help' for more information and options.

IMPORTANT: You may need to close and restart your shell after running 'conda init'.

Si au contraire je le fais:

source deactivate
conda activate myEnv

Tout fonctionne très bien. which pythonpointe vers le bon chemin.

— jose.marcos.rf
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Ce problème est provoqué par l'approvisionnement TMux ~/.profileau lieu de ~/.bashrc. Mon ~/.profileest ceci:

# if running bash
if [ -n "$BASH_VERSION" ]; then
    # include .bashrc if it exists
    if [ -f "$HOME/.bashrc" ]; then
    . "$HOME/.bashrc"
    fi
fi

# set PATH so it includes user's private bin if it exists
if [ -d "$HOME/bin" ] ; then
    PATH="$HOME/bin:$PATH"
fi

# set PATH so it includes user's private bin if it exists
if [ -d "$HOME/.local/bin" ] ; then
    PATH="$HOME/.local/bin:$PATH"
fi

Vous pouvez voir que la première ~/.bashrc provient et ensuite ~/bin et ~/.local/binsont préfixés . Comme je l'ai vécu moi - même , cela provoque condades hickups.

La solution serait de commenter les deux blocs manipulant PATH dans ~/.profile.

Edit (2019/09/24): Une meilleure solution semble être de configurer TMux de sorte qu'il ne génère pas un shell de connexion mais juste un shell normal. Voir les réponses pour la question liée.

— Max Görner
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Fonctionnement:

conda activate env1

Au lieu de:

source activate env1

Lorsque l'intérieur de tmux a fonctionné pour moi.

— pedrodcb
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Je trouve que tmux appellera toujours le profil de votre shell, pas seulement le rc. Donc, si vous utilisez bash comme moi, il appellera / etc / profile, qui appellera path_helper.

Pour résoudre ce problème, passez /etc/profileà:

if [[ -z $TMUX ]] && [ -x /usr/libexec/path_helper ]; then
        eval `/usr/libexec/path_helper -s`
fi

Si vous utilisez bash, changer aussi tout export PATH=$PATH:/foodans .bashrcla

if [[ -z $TMUX ]]; then
  export PATH=$PATH:/foo
fi

puis vous redémarrez le terminal (par exemple Iterm). Tout devrait être bon!

— H.Li
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nano ~/.bash_profile

Ajoutez les lignes suivantes:

source deactivate env1
source activate env1

travaillé pour moi.

— Kensuke NAKAMURA
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