Réponses:
Il y a Exherbo , qui utilise plusieurs référentiels Git pour stocker ses exheres (son terme pour les recettes de construction similaires aux ebuilds de Gentoo ou aux ports BSD). C'est quand même une distribution assez jeune.
Mise à jour: Gentoo a récemment migré vers Git pour son référentiel de packages . Cependant, je ne pense pas qu'il soit encore configuré pour que les utilisateurs normaux reçoivent des mises à jour via Git (bien que je pense qu'il est prévu de le permettre).
Vous mentionnez spécifiquement l'homebrew; linuxbrew est un fork d'homebrew destiné à linux. Deets ici: http://linuxbrew.sh/