En tant que quelqu'un qui l'a fait, j'aime le bus. Bien sûr, il y a des avantages et des inconvénients pour chacun.
Autobus
Avantages : Un bus coûte moins cher, vous pouvez voir plus de la campagne, interagir avec plus de gens. Vous bénéficiez de pauses, de bons sièges (ils ont des bus de classe affaires!) Et vous pouvez vous arrêter à certains endroits sur le chemin. Nous nous sommes arrêtés à Arequipa pour aller au Canyon de Colca, et à Nazca pendant quelques heures pour voir les lignes de Nazca.
Inconvénients : cela prend beaucoup de temps. Certaines jambes dans le désert peuvent être ternes. Certaines personnes affirment que c'est une route dangereuse, mais je dirais que ce n'est peut-être que dans les montagnes - la route côtière de Nazca à Lima est moderne et de haute qualité.
Avion
Avantages : vous y arrivez plus rapidement. Vous obtenez une vue aérienne. Gagner du temps.
Inconvénients : c'est plus cher. Vous n'aurez pas une introduction graduelle à l'altitude, et peut en conséquence être un peu choqué lorsque vous descendez de l'avion - cela peut être assez difficile les premiers jours. Vous êtes coincé dans un siège exigu en classe économique. Vous ne pouvez pas interagir avec beaucoup de gens.
J'espère que cela aide. Personnellement, même si j'ai pris le bus la dernière fois, si j'avais le temps, je le ferais à nouveau. Je ne suis pas d'accord avec @vartec - le choix n'est pas évident et j'ai adoré le voyage en bus. Mais vous devez prendre cette décision vous-même, bien sûr :)