Réparation et réinstallation de Windows 7

J'utilise Windows 7 Home Basic sur mon ordinateur portable. Parallèlement, j’ai installé Ubuntu 11.04 avec WUBI et, dans une autre partition de mon disque dur, j’ai également installé Ubuntu 11.04.

Si je répare Windows 7 à l'aide de son CD d'amorçage ou si je le réinstalle, quel pourrait en être l'impact sur les deux installations Ubuntu?
Est-ce que réparer supprimera le premier, et le fichier installé par le partenaire Ubuntu (c'est-à-dire le deuxième) sera-t-il supprimé?

Je suis certain (par expérience) que le système installé par Wubi sera affecté. vous le démarrez via le chargeur de démarrage Windows et il est stocké dans une "partition virtuelle" (c'est-à-dire un gros fichier) dans Windows. Le meilleur scénario est de le récupérer avec wubi, le pire (et mon expérience) est que le système devient irrécupérable. Cependant, aucun autre système ne serait affecté.