Ça dépend
D'après mon expérience avec CentOS, c'est assez sûr car vous n'utilisez que les référentiels de base CentOS.
Si vous vous attendez à des mises à jour échouées de temps en temps ... oui ... au même niveau que vous devriez vous attendre à un disque dur défaillant ou à un processeur défaillant de temps en temps. Vous ne pouvez jamais avoir trop de sauvegardes. :-)
La bonne chose à propos des mises à jour automatisées est que vous obtenez des correctifs (et donc plus de sécurité) plus rapidement que de le faire manuellement.
Les correctifs manuels semblent toujours être repoussés ou considérés comme "à faible priorité" pour tant d'autres choses, donc si vous allez passer en mode manuel, PLANIFIEZ LE TEMPS SUR VOTRE CALENDRIER pour le faire.
J'ai configuré de nombreuses machines pour faire des mises à jour automatiques (via le travail cron) et j'ai rarement eu un problème. En fait, je ne me souviens pas avoir eu de problème avec les référentiels BASE. Chaque problème auquel je peux penser (du haut de ma tête, selon mon expérience) a toujours été une situation de tiers.
Cela étant dit ... J'ai plusieurs machines pour lesquelles je fais manuellement les mises à jour. Des choses comme les serveurs de bases de données et d'autres systèmes extrêmement critiques j'aime avoir une approche "pratique".
La façon dont je l'ai compris personnellement était comme ça ... Je pense au scénario "et si" et ensuite j'essaye de penser au temps qu'il faudrait pour reconstruire ou restaurer à partir d'une sauvegarde et ce qui (le cas échéant) serait perdu .
Dans le cas de plusieurs serveurs Web ... ou de serveurs dont le contenu ne change pas beaucoup ... Je vais de l'avant et je fais une mise à jour automatique car le temps de reconstruction / restauration est minime.
Dans le cas des serveurs de bases de données critiques, etc ... Je planifie du temps une fois par semaine pour les examiner et les corriger manuellement ... car le temps nécessaire pour reconstruire / restaurer prend plus de temps.
Selon les serveurs que VOUS avez sur votre réseau et la façon dont votre plan de sauvegarde / restauration est mis en œuvre, vos décisions peuvent être différentes.
J'espère que cela t'aides.