Subversion, Git, Mercurial et autres prennent en charge les fusions à trois voies (combinant la mienne, la leur et la révision "de base") et prennent en charge des outils graphiques pour résoudre les conflits.
Quel outil utilisez-vous? Windows, Mac OS X, Linux, gratuit ou commercial, vous l'appelez.
Voici quelques-uns que j'ai utilisés ou entendu parler, juste pour démarrer la conversation:
(Je reconnais que c'est un peu comme le meilleur outil de diff , mais c'est différent en ce que je me concentre explicitement sur les outils de fusion à trois voies; WinMerge est hors de la liste, par exemple.)