Remplacer toutes les valeurs particulières dans une trame de données

Ayant un bloc de données, comment puis-je remplacer toutes les valeurs particulières le long de toutes les lignes et colonnes. Disons par exemple que je veux remplacer tous les enregistrements vides par des NA's (sans taper les positions):

df <- data.frame(list(A=c("", "xyz", "jkl"), B=c(12, "", 100)))

    A   B
1      12
2  xyz    
3  jkl 100

Résultat attendu:

    A   B
1  NA   12
2  xyz  NA  
3  jkl  100

Comme ça:

> df[df==""]<-NA
> df
     A    B
1 <NA>   12
2  xyz <NA>
3  jkl  100

Puisque PikkuKatja et glallen ont demandé une solution plus générale et que je ne peux pas encore commenter, j'écrirai une réponse. Vous pouvez combiner des instructions comme dans:

> df[df=="" | df==12] <- NA
> df
     A    B
1  <NA> <NA>
2  xyz  <NA>
3  jkl  100

Pour les facteurs, le code de zxzak donne déjà des facteurs:

> df <- data.frame(list(A=c("","xyz","jkl"), B=c(12,"",100)))
> str(df)
'data.frame':   3 obs. of  2 variables:
 $ A: Factor w/ 3 levels "","jkl","xyz": 1 3 2
 $ B: Factor w/ 3 levels "","100","12": 3 1 2

En cas de problème, je suggérerais de supprimer temporairement les facteurs.

df[] <- lapply(df, as.character)

Voici quelques dplyroptions:

library(dplyr)

# all columns:
df %>% 
  mutate_all(~na_if(., ''))

# specific column types:
df %>% 
  mutate_if(is.factor, ~na_if(., ''))

# specific columns:  
df %>% 
  mutate_at(vars(A, B), ~na_if(., ''))

# or:
df %>% 
  mutate(A = replace(A, A == '', NA))

# replace can be used if you want something other than NA:
df %>% 
  mutate(A = as.character(A)) %>% 
  mutate(A = replace(A, A == '', 'used to be empty'))

Nous pouvons utiliser data.table pour l'obtenir rapidement. Créez d'abord df sans facteurs,

df <- data.frame(list(A=c("","xyz","jkl"), B=c(12,"",100)), stringsAsFactors=F)

Vous pouvez maintenant utiliser

setDT(df)
for (jj in 1:ncol(df)) set(df, i = which(df[[jj]]==""), j = jj, v = NA)

et vous pouvez le reconvertir en data.frame

setDF(df)

Si vous souhaitez uniquement utiliser data.frame et conserver les facteurs, c'est plus difficile, vous devez travailler avec

levels(df$value)[levels(df$value)==""] <- NA

où valeur est le nom de chaque colonne. Vous devez l'insérer dans une boucle.

Si vous souhaitez remplacer plusieurs valeurs dans un bloc de données, une boucle sur toutes les colonnes peut être utile.

Dites que vous souhaitez remplacer ""et 100:

na_codes <- c(100, "")
for (i in seq_along(df)) {
    df[[i]][df[[i]] %in% na_codes] <- NA
}