J'utilise Knitr via R-Studio, et je pense que c'est assez soigné. J'ai un problème mineur cependant. Lorsque je source un fichier dans un R-Chunk, la sortie knitr inclut des commentaires externes comme suit:
+ FALSE Loading required package: ggplot2
+ FALSE Loading required package: gridExtra
+ FALSE Loading required package: grid
+ FALSE Loading required package: VGAM
+ FALSE Loading required package: splines
+ FALSE Loading required package: stats4
+ FALSE Attaching package: 'VGAM'
+ FALSE The following object(s) are masked from 'package:stats4':
J'ai essayé de définir les options des blocs R de différentes manières, mais je n'ai toujours pas semblé éviter le problème:
```{r echo=FALSE, cache=FALSE, results=FALSE, warning=FALSE, comment=FALSE, warning=FALSE}
source("C:/Rscripts/source.R");
```
Existe-t-il un moyen de commenter ces messages?
options(warn=-1)
et reveniroptions(warn=0)
à la fin de la Rmd. Prend soin de tous les messages du package de démarrage. Notez que vous désactiveriez les avertissements, mais uniquement pendant le rendu du Rmd.