Tracez yerr / xerr comme une région ombrée plutôt que comme des barres d'erreur

142

Dans matplotlib, comment tracer l'erreur comme une région ombrée plutôt que comme des barres d'erreur?

Par exemple:

plutôt que

python matplotlib

— Austin Richardson
source

Comment le graphique supérieur a-t-il été généré?

— MichaelSB

Est-ce que cela répond à votre question? Tracé de la région d'incertitude ombrée dans un tracé linéaire dans matplotlib lorsque les données ont NaNs

— Reinderien

Réponses:

151

En ignorant l'interpolation fluide entre les points de votre exemple de graphique (qui nécessiterait une interpolation manuelle, ou simplement une résolution plus élevée de vos données), vous pouvez utiliser pyplot.fill_between():

from matplotlib import pyplot as plt
import numpy as np

x = np.linspace(0, 30, 30)
y = np.sin(x/6*np.pi)
error = np.random.normal(0.1, 0.02, size=y.shape)
y += np.random.normal(0, 0.1, size=y.shape)

plt.plot(x, y, 'k-')
plt.fill_between(x, y-error, y+error)
plt.show()

entrez la description de l'image ici

Voir aussi les exemples matplotlib .

— Gabriel
source

Parfait. Ouais, je ne voulais pas inclure un exemple avec des lignes lissées.

— Austin Richardson

Une idée comment faire de ce spectacle des boîtes ombrées au lieu d'une bande ombrée? Mon premier instinct a été d'abuser lwmais il semble ne pas utiliser les mêmes unités que les haches.

— Benjamin Bannier

@BenjaminBannier Je ne suis pas tout à fait sûr de ce que vous voulez dire. Il semble que vous souhaitiez une boîte dessinée à chaque point, sa hauteur est la même que celle de la barre d'erreur, tandis que la largeur doit être telle qu'ils connectent (touchent) les boîtes voisines. Est-ce exact?

@EL_DON Vous voulez dire que vous aimeriez une légende avec une ligne noire + une bande bleue, et le texte serait quelque chose comme "données + 1 région d'erreur sigma"?

@Allan si les seules barres d'erreur que vous avez sont horizontales, vous devriez probablement retourner les axes de votre problème réel (et donc aussi la figure). Normalement, la variable indépendante est celle sans (ou avec de très petites) barres d'erreur. Vous pourrez peut-être tricher, en échangeant vos variables de données, et dans matplotlib, en échangeant également les axes.

131

C'est fondamentalement la même réponse fournie par Evert , mais étendue pour montrer quelques options intéressantes defill_between

entrez la description de l'image ici

from matplotlib import pyplot as pl
import numpy as np

pl.clf()
pl.hold(1)

x = np.linspace(0, 30, 100)
y = np.sin(x) * 0.5
pl.plot(x, y, '-k')


x = np.linspace(0, 30, 30)
y = np.sin(x/6*np.pi)
error = np.random.normal(0.1, 0.02, size=y.shape) +.1
y += np.random.normal(0, 0.1, size=y.shape)

pl.plot(x, y, 'k', color='#CC4F1B')
pl.fill_between(x, y-error, y+error,
    alpha=0.5, edgecolor='#CC4F1B', facecolor='#FF9848')

y = np.cos(x/6*np.pi)    
error = np.random.rand(len(y)) * 0.5
y += np.random.normal(0, 0.1, size=y.shape)
pl.plot(x, y, 'k', color='#1B2ACC')
pl.fill_between(x, y-error, y+error,
    alpha=0.2, edgecolor='#1B2ACC', facecolor='#089FFF',
    linewidth=4, linestyle='dashdot', antialiased=True)



y = np.cos(x/6*np.pi)  + np.sin(x/3*np.pi)  
error = np.random.rand(len(y)) * 0.5
y += np.random.normal(0, 0.1, size=y.shape)
pl.plot(x, y, 'k', color='#3F7F4C')
pl.fill_between(x, y-error, y+error,
    alpha=1, edgecolor='#3F7F4C', facecolor='#7EFF99',
    linewidth=0)



pl.show()

— Boris Gorelik
source

Solution légèrement meilleure: stackoverflow.com/questions/43064524/…

— Shital Shah