Comment passer l'argument de ligne de commande à gnuplot?

Je veux utiliser gnuplot pour dessiner une figure à partir d'un fichier de données, disons foo.data . Actuellement, j'ai codé en dur le nom du fichier de données dans le fichier de commandes, disons foo.plt , et j'ai exécuté la commande gnuplot foo.plgpour tracer les données. Cependant, je veux passer le nom du fichier de données comme argument de commande, par exemple commande en cours d'exécution gnuplot foo.plg foo.data. Comment analyser les arguments de ligne de commande dans le fichier de script gnuplot? Merci.

Vous pouvez saisir des variables via le commutateur -e

$ gnuplot -e "filename='foo.data'" foo.plg

Dans foo.plg, vous pouvez ensuite utiliser cette variable

$ cat foo.plg 
plot filename
pause -1

Pour rendre "foo.plg" un peu plus générique, utilisez un conditionnel:

if (!exists("filename")) filename='default.dat'
plot filename
pause -1

Notez que -edoit précéder le nom de fichier sinon le fichier s'exécute avant les -einstructions. En particulier, exécuter un gnuplot shebang #!/usr/bin/env gnuplotavec des ./foo.plg -e ...arguments CLI ignorera l'utilisation des arguments fournis.

Vous pouvez passer des arguments à un script gnuplot depuis la version 5.0, avec l'indicateur -c. Ces arguments sont accessibles via les variables ARG0à ARG9, ARG0étant le script, et ARG1aux ARG9variables de chaîne. Le nombre d'arguments est donné par ARGC.

Par exemple, le script suivant ("script.gp")

#!/usr/local/bin/gnuplot --persist

THIRD=ARG3
print "script name        : ", ARG0
print "first argument     : ", ARG1
print "third argument     : ", THIRD 
print "number of arguments: ", ARGC 

peut être appelé comme:

$ gnuplot -c script.gp one two three four five
script name        : script.gp
first argument     : one
third argument     : three
number of arguments: 5

ou dans gnuplot comme

gnuplot> call 'script.gp' one two three four five
script name        : script.gp
first argument     : one
third argument     : three
number of arguments: 5

Dans gnuplot 4.6.6 et versions antérieures, il existe un callmécanisme avec une syntaxe différente (désormais obsolète). Les arguments sont accessibles par $#, $0..., $9. Par exemple, le même script ci-dessus ressemble à:

#!/usr/bin/gnuplot --persist

THIRD="$2"
print "first argument     : ", "$0"
print "second argument    : ", "$1"
print "third argument     : ", THIRD
print "number of arguments: ", "$#"

et il est appelé dans gnuplot comme (rappelez-vous, version <4.6.6)

gnuplot> call 'script4.gp' one two three four five
first argument     : one
second argument    : two
third argument     : three
number of arguments: 5

Notez qu'il n'y a pas de variable pour le nom du script, de même que $0le premier argument, et les variables sont appelées entre guillemets. Il n'y a aucun moyen de l'utiliser directement à partir de la ligne de commande, uniquement par des astuces comme celle suggérée par @ con-fu-se.

Vous pouvez également transmettre des informations via l'environnement comme suggéré ici . L'exemple d' Ismail Amin est répété ici:

Dans la coquille:

export name=plot_data_file

Dans un script Gnuplot:

#! /usr/bin/gnuplot

name=system("echo $name")
set title name
plot name using ($16 * 8):20 with linespoints notitle
pause -1

La réponse de Jari Laamanen est la meilleure solution. Je veux juste expliquer comment utiliser plus d'un paramètre d'entrée avec des variables shell:

output=test1.png
data=foo.data
gnuplot -e "datafile='${data}'; outputname='${output}'" foo.plg

et foo.plg:

set terminal png
set outputname 
f(x) = sin(x)
plot datafile

Comme vous pouvez le voir, plus de paramètres sont passés avec des points-virgules (comme dans les scripts bash), mais les variables de chaîne DOIVENT être encapsulées avec '' (syntaxe gnuplot, PAS syntaxe Bash)

Vous pouvez utiliser astuce dans un environnement unix / linux:

1. dans le programme gnuplot: plot "/ dev / stdin" ...

2. En ligne de commande: gnuplot program.plot <data.dat

Cette question a reçu une bonne réponse, mais je pense que je peux trouver un créneau à combler ici, ne serait-ce que pour réduire la charge de travail de quelqu'un qui cherche sur Google comme moi. La réponse de vagoberto m'a donné ce dont j'avais besoin pour résoudre ma version de ce problème et je vais donc partager ma solution ici.

J'ai développé un script de tracé dans un environnement à jour qui m'a permis de faire:

#!/usr/bin/gnuplot -c 
set terminal png truecolor transparent crop
set output ARG1
set size 1, 0.2
rrLower = ARG2
rrUpper = ARG3
rrSD = ARG4
resultx = ARG5+0 # Type coercion required for data series
resulty = 0.02 # fixed
# etc.

Cela s'exécute parfaitement bien depuis la ligne de commande dans un environnement avec un gnuplot récent (5.0.3 dans mon cas).

$ ./plotStuff.gp 'output.png' 2.3 6.7 4.3 7

Une fois téléchargé sur mon serveur et exécuté, il a échoué car la version du serveur était 4.6.4 (actuelle sur Ubuntu 14.04 LTS). Le shim ci-dessous a résolu ce problème sans nécessiter de modification du script d'origine.

#!/bin/bash
# GPlot v<4.6.6 doesn't support direct command line arguments.
#This script backfills the functionality transparently.
SCRIPT="plotStuff.gp"
ARG1=$1
ARG2=$2
ARG3=$3
ARG4=$4
ARG5=$5
ARG6=$6

gnuplot -e "ARG1='${ARG1}'; ARG2='${ARG2}'; ARG3='${ARG3}'; ARG4='${ARG4}'; ARG5='${ARG5}'; ARG6='${ARG6}'" $SCRIPT

La combinaison de ces deux scripts permet de passer des paramètres des scripts bash aux scripts gnuplot sans tenir compte de la version de gnuplot et dans pratiquement n'importe quel * nix.

Vous pouvez même faire de la magie de shell, par exemple comme ceci:

#!/bin/bash
inputfile="${1}" #you could even do some getopt magic here...

################################################################################
## generate a gnuplotscript, strip off bash header
gnuplotscript=$(mktemp /tmp/gnuplot_cmd_$(basename "${0}").XXXXXX.gnuplot)

firstline=$(grep -m 1 -n "^#!/usr/bin/gnuplot" "${0}")
firstline=${firstline%%:*} #remove everything after the colon
sed -e "1,${firstline}d" < "${0}" > "${gnuplotscript}"


################################################################################
## run gnuplot
/usr/bin/gnuplot -e "inputfile=\"${inputfile}\"" "${gnuplotscript}"
status=$?
if [[ ${status} -ne 0 ]] ; then
  echo "ERROR: gnuplot returned with exit status $?"
fi

################################################################################
## cleanup and exit
rm -f "${gnuplotscript}"
exit ${status}

#!/usr/bin/gnuplot
plot inputfile using 1:4 with linespoints
#... or whatever you want

Mon implémentation est un peu plus complexe (ex: remplacement de quelques jetons magiques dans l'appel sed, alors que j'y suis déjà ...), mais j'ai simplifié cet exemple pour une meilleure compréhension. Vous pouvez également le rendre encore plus simple ... YMMV.

Dans le shell, écrivez

gnuplot -persist -e "plot filename1.dat,filename2.dat"

et consécutivement les fichiers souhaités. -persist est utilisé pour faire en sorte que l'écran de gnuplot reste tant que l'utilisateur ne le quitte pas manuellement.

Encore une autre façon est la suivante:

Vous avez un script gnuplot nommé scriptname.gp:

#!/usr/bin/gnuplot -p
# This code is in the file 'scriptname.gp'
EPATH = $0
FILENAME = $1 

plot FILENAME

Vous pouvez maintenant appeler le script gnuplot scriptname.gppar cette paix de syntaxe alambiquée:

echo "call \"scriptname.gp\" \"'.'\" \"'data.dat'\"" | gnuplot 

La réponse de @ vagoberto semble la meilleure à mon humble avis si vous avez besoin d'arguments de position , et j'ai une petite amélioration à ajouter.

suggestion de vagoberto:

#!/usr/local/bin/gnuplot --persist

THIRD=ARG3
print "script name        : ", ARG0
print "first argument     : ", ARG1
print "third argument     : ", THIRD 
print "number of arguments: ", ARGC 

qui est appelé par:

$ gnuplot -c script.gp one two three four five
script name        : script.gp
first argument     : one
third argument     : three
number of arguments: 5

pour ces typeurs paresseux comme moi, on pourrait rendre le script exécutable ( chmod 755 script.gp)

puis utilisez ce qui suit:

#!/usr/bin/env gnuplot -c

THIRD=ARG3
print "script name        : ", ARG0
print "first argument     : ", ARG1
print "third argument     : ", THIRD
print "number of arguments: ", ARGC

et exécutez-le comme:

$ ./imb.plot a b c d
script name        : ./imb.plot
first argument     : a
third argument     : c
number of arguments: 4