Passer de la liste de diffusion gdal-dev:
Le lundi 2 septembre 2013 à 19 h 09, David Shean a écrit:
Hi list, j'essaie de regrouper une série temporelle de rasters GTiff avec une projection / étendue / résolution identique à un seul fichier NetCDF pour la distribution. J'ai passé la dernière heure à consulter le doc en ligne et à jouer avec gdal_translate, gdalbuildvrt et gdalwarp sans succès.
Existe-t-il un moyen simple de le faire en utilisant les utilitaires de ligne de commande gdal existants? J'ai pensé que je demanderais avant de recourir à une solution personnalisée à l'aide de l'API NetCDF Python.
Merci. -David
Le mar 3 septembre 2013 à 10 h 15, Etienne Tourigny a écrit:
ce que vous voulez est probablement hors de portée de gdal. Cela nécessiterait une gestion intelligente des métadonnées pour que gdal_translate les place dans un seul fichier ...
Je vous conseille de les convertir tous en netcdf en utilisant gdal_translate puis d'utiliser python-netcdf4 (pas celui de numpy / scipy) pour les empiler dans la dimension temporelle.
Le mardi 3 septembre 2013, à 7 h 55, "Signell, Richard" a écrit:
David, Si vous postez votre question sur le groupe stackexchange SIG /gis// je fournirai un exemple de code qui devrait être utile.
-Riches
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Mise à jour 9/3/13 17:04 PDT
Voici la sortie gdalinfo pour l'un de mes jeux de données d'entrée:
gdalinfo 20120901T2024_align_x+22.19_y+3.68_z+14.97_warp.tif
Driver: GTiff/GeoTIFF
Files: 20120901T2024_align_x+22.19_y+3.68_z+14.97_warp.tif
Size is 10666, 13387
Coordinate System is:
PROJCS["unnamed",
GEOGCS["WGS 84",
DATUM["WGS_1984",
SPHEROID["WGS 84",6378137,298.257223563,
AUTHORITY["EPSG","7030"]],
AUTHORITY["EPSG","6326"]],
PRIMEM["Greenwich",0],
UNIT["degree",0.0174532925199433],
AUTHORITY["EPSG","4326"]],
PROJECTION["Polar_Stereographic"],
PARAMETER["latitude_of_origin",70],
PARAMETER["central_meridian",-45],
PARAMETER["scale_factor",1],
PARAMETER["false_easting",0],
PARAMETER["false_northing",0],
UNIT["metre",1,
AUTHORITY["EPSG","9001"]]]
Origin = (-211346.063781524338992,-2245136.291794800199568)
Pixel Size = (5.000000000000000,-5.000000000000000)
Metadata:
AREA_OR_POINT=Area
Image Structure Metadata:
COMPRESSION=LZW
INTERLEAVE=BAND
Corner Coordinates:
Upper Left ( -211346.064,-2245136.292) ( 50d22'39.70"W, 69d23'55.59"N)
Lower Left ( -211346.064,-2312071.292) ( 50d13'22.38"W, 68d48'10.75"N)
Upper Right ( -158016.064,-2245136.292) ( 49d 1'33.33"W, 69d26'16.42"N)
Lower Right ( -158016.064,-2312071.292) ( 48d54'35.06"W, 68d50'27.28"N)
Center ( -184681.064,-2278603.792) ( 49d38' 1.32"W, 69d 7'17.04"N)
Band 1 Block=256x256 Type=Float32, ColorInterp=Gray
NoData Value=-32767
Suivi de l'approche suggérée par Luke.
La génération vrt fonctionne bien:
gdalbuildvrt -separate newtest.vrt *warp.tif
<VRTDataset rasterXSize="10666" rasterYSize="13387">
<SRS>PROJCS["unnamed",GEOGCS["WGS 84",DATUM["WGS_1984",SPHEROID["WGS 84",6378137,298.257223563,AUTHORITY["EPSG","7030"]],AUTHORITY["EPSG","6326"]],PRIMEM["Greenwich",0],UNIT["degree",0.0174532925199433],AUTHORITY["EPSG","4326"]],PROJECTION["Polar_Stereographic"],PARAMETER["latitude_of_origin",70],PARAMETER["central_meridian",-45],PARAMETER["scale_factor",1],PARAMETER["false_easting",0],PARAMETER["false_northing",0],UNIT["metre",1,AUTHORITY["EPSG","9001"]]]</SRS>
<GeoTransform> -2.1134606378152434e+05, 5.0000000000000000e+00, 0.0000000000000000e+00, -2.2451362917948002e+06, 0.0000000000000000e+00, -5.0000000000000000e+00</GeoTransform>
<VRTRasterBand dataType="Float32" band="1">
<NoDataValue>-3.27670000000000E+04</NoDataValue>
<ComplexSource>
<SourceFilename relativeToVRT="1">20110619T2024_align_x+15.51_y+1.15_z+12.10_warp.tif</SourceFilename>
<SourceBand>1</SourceBand>
<SourceProperties RasterXSize="10666" RasterYSize="13387" DataType="Float32" BlockXSize="256" BlockYSize="256" />
<SrcRect xOff="0" yOff="0" xSize="10666" ySize="13387" />
<DstRect xOff="0" yOff="0" xSize="10666" ySize="13387" />
<NODATA>-32767</NODATA>
</ComplexSource>
</VRTRasterBand>
<VRTRasterBand dataType="Float32" band="2">
<NoDataValue>-3.27670000000000E+04</NoDataValue>
<ComplexSource>
<SourceFilename relativeToVRT="1">20110802T2024_align_x+16.33_y+2.14_z+12.02_warp.tif</SourceFilename>
<SourceBand>1</SourceBand>
<SourceProperties RasterXSize="10666" RasterYSize="13387" DataType="Float32" BlockXSize="256" BlockYSize="256" />
<SrcRect xOff="0" yOff="0" xSize="10666" ySize="13387" />
<DstRect xOff="0" yOff="0" xSize="10666" ySize="13387" />
<NODATA>-32767</NODATA>
</ComplexSource>
</VRTRasterBand>
...
Mais lorsque j'essaie de traduire en nc, j'obtiens l'erreur suivante:
gdal_translate -of netcdf newtest.vrt newtest.nc
Input file size is 10666, 13387
Warning 1: Variable has 0 dimension(s) - not supported.
0...10...20...30...40...50ERROR 1: netcdf error #-62 : NetCDF: One or more variable sizes violate format constraints .
at (netcdfdataset.cpp,SetDefineMode,1574)
ERROR 1: netcdf error #-39 : NetCDF: Operation not allowed in define mode .
at (netcdfdataset.cpp,IWriteBlock,1435)
ERROR 1: netCDF scanline write failed: NetCDF: Operation not allowed in define mode
ERROR 1: An error occured while writing a dirty block
...ERROR 1: netcdf error #-39 : NetCDF: Operation not allowed in define mode .
at (netcdfdataset.cpp,IWriteBlock,1435)
ERROR 1: netCDF scanline write failed: NetCDF: Operation not allowed in define mode
ERROR 1: netcdf error #-62 : NetCDF: One or more variable sizes violate format constraints .
at (netcdfdataset.cpp,~netCDFDataset,1548)
Donc, en y regardant de plus près, il semble que gdal ne soit pas satisfait de la projection stéréographique polaire que j'utilise (EPSG: 3413). Voir les lignes 1570-1582 de netcdfdataset.cpp:
Ma projection a une latitude_of_origin spécifiée mais aucun parallèle standard comme prévu par le pilote netcdf.