De nouvelles installations de QGIS 3.0.x créent systématiquement un dossier "palettes" dans c: / sous Windows. Même si vous le supprimez, il est recréé après chaque redémarrage / réinstallation de QGIS.
Une astuce pour vous débarrasser de ce dossier une fois pour toutes? Ou au moins pour changer le chemin dans lequel il est créé?